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SENIOR BIOSTATISTICIAN
Publiée le 04/03/2024 12:57.
Référence : GHL2024SB2.
CDI, Paris.
Entreprise/Organisme :GHLconsult cabinet de recrutement
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :dès que possible
Rémunération :80K€
Secteur d'activité :biotechnologies
Description :Laboratoire conduisant des études cliniques en France et à l'international (1 phase I, 3 phases II & 8 phases III - Amérique du Nord, Amérique du Sud, Europe, Asie) recherche un Biostatisticien Senior Missions • Author the Statistical Sections of Protocol. • Propose and Review the Study design. • Calculate the sample size. • Review the Case Report Form (CRF). • Review the Edit Check Document (specifically for critical modules like RECIST 1.1 etc.). • Write the randomization specifications and coordinate and finalize all the randomization activities with the IWRS vendor. • Author Statistical Analysis Plan (interim and final as appropriate). • Perform the Statistical Analysis (Efficacy and Safety (key safety like Adverse Events)) using SAS. • Ensure quality of all the outputs developed. • Perform the role of validator as appropriate. • Provide Statistical Consultancy on an ongoing basis for projects. • Perform Futility and Efficacy analysis as appropriate for interim analysis and interact with third party independent Statistician. • Defend the Statistical Analysis at the IDMC meetings as appropriate. • Write the specifications for the efficacy analysis. Review the Specifications for the Safety Analysis. • Organize Data Review Meetings (equivalent to Blinded Data Review (BDR) or Dry Run) and lead all the statistical discussions. • Work Collaboratively with the data management, Clinical Operations, Medical Writing and the Pharmacovigilance team as appropriate. • Provide inputs to the regulatory affairs for all the discussions with the health authorities (e.g. ANSM, EMA, FDA). • Review the Clinical Study Report and provide statistical inputs as appropriate. • Perform exploratory analysis as appropriate. Profil • Female or male • Ph.D. in Statistics with minimum 3 years of relevant pharmaceutical (or CRO) industry work experience or Masters in Statistics or equivalent with minimum 5 relevant pharmaceutical (or CRO) industry work experience. • Good Knowledge of SAS. • Preliminary working knowledge on R. • Good Understanding of CDISC Concepts. • Good understanding of ICH guidelines. • Decent written and verbal English communications skills. • Good Team Player. • Innovative mindset. • Good interpersonal skills. • Good time management. Terms and conditions • Permanent contract (CDI) to be filled as soon as possible • Paris based post office • Salary to be defined according to profile and experience • The company sponsors the EU work visa if needed
En savoir plus :www.ghlconsult.com
Senior Biostatistician permanent contract Paris 2024.pdf
Contact :gilleslaurent@ghlconsult.com
Traitement des données de surveillance avancée des photobioréacteurs
Publiée le 04/03/2024 12:57.
Stage, Nantes.
Entreprise/Organisme :ONIRIS Ecole VetAgroBio
Niveau d'études :Master
Sujet :Les microalgues ont un potentiel de valorisation biotechnologique très prometteur (biocarburants, molécules à haute valeur ajoutée, bioremédiation). Il existe différentes technologies de systèmes de culture de microalgues, en milieu ouvert ou fermé. La culture en photobioréacteurs permet un meilleur contrôle des conditions de culture et requiert un pilotage précis du procédé. Le suivi de culture en photobioréacteurs de microalgues fait dorénavant appel à une nouvelle génération de capteurs tels que la RMN, le Raman, ou la micro-spectrométrie. Outre les mesures collectées avec des méthodes de référence hors ligne (concentrations en pigments, biomasse sèche, prootéines, lipides, …) et en ligne (pH, température, turbidité, O2 et CO2 dissous), ces capteurs en ligne permettent de collecter efficacement de nombreuses métadonnées pour une approche de pilotage plus intégrée/systémique ou pour une meilleure compréhension de la dynamique du système de culture dans des conditions différentes.
Date de début :25/03/2024
Durée du contrat :5 à 6 mois
Rémunération :600 € /mois
Secteur d'activité :Statistique appliquée
Description :Dans ce sujet de stage, il est proposé de prendre en main et d'exploiter une base de données comprenant des données RMN, Raman, pH, température, spectre UV-vis, données météorologiques, etc. provenant d'une expérience d'intégration réalisée sur l'installation ALGOSOLIS (GEPEA, UMR-CNRS 6144 http://algosolis.com/) impliquant des méta mesures réalisées au cours d'une expérience de culture solaire de microalgues oléagineuses, menées dans des conditions de carence minérale visant à maximiser leur teneur en lipides. L’objectif sera ici de proposer un outil de suivi en ligne basée sur les données comme un outil d’aide au pilotage pour l’opérateur. Son intégration dans une boucle de rétroaction pour un pilotage automatique du système sera envisagée. Après une phase de pré-traitement et uniformisation des données disponibles, il s’agira pour le stagiaire de mettre en œuvre des méthodes d’exploration de ces données de grandes dimensions, multiblocs et multivoies. On cherchera en particulier à intégrer les différents blocs de mesure de profilage haut-débit et à d’établir des liens entre les données de pilotage du procédé et la dynamique de la production de molécules algales au cours de la culture.
En savoir plus :https://www.oniris-nantes.fr/
1_2023_DOMULO_Stage M2_StatSC BAM MT.pdf
Contact :evelyne.vigneau@oniris-nantes.fr
Exploitation de données multidim. longitudinales pour le monitoring avancé de la digestion anaérobie
Publiée le 22/02/2024 11:14.
Stage, ONIRIS, rue de la géraudière 44300 NANTES.
Entreprise/Organisme :ONIRIS StatSC
Niveau d'études :Master
Sujet :Dans ce contexte, l’objectif du stage sera de mettre en place un pipeline analytique spécifique pour la valorisation des données omiques longitudinales issues de bioprocédés. Différents défis statistiques seront à résoudre (Kodikara et al. 2022). Des jeux de données omiques (metataxonomique, métagénomique, métabolomique) issues d’échantillons prélevés dans des bioréacteurs de laboratoire sont disponibles. Elles proviennent d’expériences réalisées dans l’unité PROSE pour évaluer les conséquences de différents stress salins sur les performances de la digestion anaérobie. On pourra s’appuyer sur des travaux préliminaires précédents (Bodein et al. 2019, Chapleur et al. 2021).
Date de début :Mars ou Avril 2024
Durée du contrat :5 à 6 mois
Rémunération :600 €/mois
Secteur d'activité :Statistique appliqué
Description :Le stage se déroulera au sein de l’unité de recherche StatSC (Oniris VetAgroBio/INRAE) à Nantes. Il sera co-encadré par l’unité de recherche PROSE (Procédés biOtechnologiques au Service de l’Environnement) de l’INRAE à Jouy-en- Josas. Il bénéficie d’un financement du département Transform de l’INRAE.
En savoir plus :NA
DOMULO_Stage M2_StatSC Prose.pdf
Contact :veronique.cariou@oniris-nantes.fr
Supervised classification of wood and charcoal from microscopic images
Publiée le 13/02/2024 12:26.
Référence : marco.corneli@univ-cotedazur.fr.
Stage, Nice et Sophia-Antipolis.
Entreprise/Organisme :Université Côte d'Azur
Niveau d'études :Master
Description :See the joint pdf
En savoir plus :All useful information in the joint pdf
intern_AIWOOD.pdf
Contact :marco.corneli@univ-cotedazur.fr
Proposition de stage de M2 : Partitionnement de données et quantification sur des varifolds
Publiée le 13/02/2024 11:37.
Référence : StageM2-Brécheteau-Guillermou-2024.
Stage, Laboratoire de Mathématiques Jean Leray, Nantes Université, Campus Lombarderie.
Entreprise/Organisme :Laboratoire de Mathématiques Jean Leray, École Centrale de Nantes
Niveau d'études :Master
Sujet :Partitionnement de données et quantification sur des varifolds
Date de début :à partir du 1er mars 2024
Durée du contrat :4-6 mois
Description :L'étudiant.e sera amené.e, après lecture des différentes ressources bibliographiques, à effectuer des avancées mathématiques dans la justification théorique statistique de l'algorithme des k-means sur une varifold, et/ou de ses versions robustes à différentes formes de bruit. Il/elle sera amené.e à coder en Julia ou tout autre langage une telle méthode et à l'appliquer sur des données simulées. Ce code pourra être intégré par exemple à la bibliothèque en construction (GeometricClusterAnalysis.jl) en Julia.
En savoir plus :NA
Proposition_stage_M2.pdf
Contact :claire.brecheteau@ec-nantes.fr
Thèse - Optimisation sous incertitudes avec contraintes physiques
Publiée le 13/02/2024 11:36.
Thèse, Palaiseau.
Entreprise/Organisme :ONERA
Niveau d'études :Master
Date de début :octobre 2024
Secteur d'activité :Aérospatial
Description :L'objectif est de proposer une méthodologie d’optimisation sous incertitudes de la sélection des bandes spectrales pour la détection d'anomalies, qui permette la prise en compte de contraintes physiques et qui soit adaptée aux variables mixtes
En savoir plus :NA
PHY-DOTA-2024-02_thèse_optim.pdf
Contact :sidonie.lefebvre@onera.fr
Professeur(e) en statistique
Publiée le 13/02/2024 11:36.
Référence : Pr en statistique à AgroParisTech.
CDI, Palaiseau (91).
Entreprise/Organisme :AgroParisTech
Niveau d'études :Doctorat
Description :Professeur(e) en statistique spécialisé(e) dans le domaine des statistiques spatio-temporelles et de la modélisation du risque
En savoir plus :https://mia-ps.inrae.fr/node/609
Notice_MMIP_PR_Stats_2024-1.pdf
Contact :celine.levy-leduc@agroparistech.fr
Scientific project manager INVENTS
Publiée le 13/02/2024 11:36.
Référence : Scientific project manager INVENTS.
CDD, PariSanté Campus 10 rue D’Oradour sur Glane, 75015, Paris.
Entreprise/Organisme :HeKA Inria Paris – Digital health research for a learning health system
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :01/03/2024 -01/04/2024
Durée du contrat :36 months
Rémunération :According to experience. PhD degree obtained
Description :HeKA is the coordinator of a Horizon Europe project, funded by the European Commission, set to start in 2024 for a duration of 5 years. This European project consists of a consortium of 15 academic and industrial partners. INSERM is looking for a Scientific Project Manager (M/F) to animate, coordinate, communicate, and develop methods within the framework of the implementation of the Horizon Europe collaborative research project "INVENTS": "Innovative designs, extrapolation, simulation methods, and evidence-tools for rare diseases addressing regulatory needs," coordinated by Professor Sarah Zohar.
En savoir plus :https://team.inria.fr/heka/
2024-INSERM-scientific-project-manager_INVENTS_Sarah Zohar.pdf
Contact :sarah.zohar@inserm.fr
Postdoc position at Mines Paris, PSL University - Spatio-temporal statistics on manifolds
Publiée le 31/01/2024 10:11.
Postdoc, Fontainebleau.
Entreprise/Organisme :Mines Paris - PSL
Niveau d'études :Doctorat
Durée du contrat :24 months
Description :The objective of this 2-year post-doc, the result of a collaboration between Mines-Paris PSL and ANDRA (French National Agency for Nuclear Waste management), is to develop statistical methods for the reconstruction and prediction of spatio-temporal data distributed over surfaces. These methods will be applied to temperature and deformation data from sensors placed on the surface of prototypes of High-Activity nuclear waste storage cells. The recruited person will be integrated into the Geostatistics team at the Mines Paris Geosciences center (Fontainebleau, 77). You will find more information in the detailed offer below: French: https://chaire-geolearning.org/wp-content/uploads/2023/11/postdoc-mines-andra-fr.pdf English: https://chaire-geolearning.org/wp-content/uploads/2023/11/postdoc-mines-andra-en.pdf
En savoir plus :https://chaire-geolearning.org/wp-content/uploads/2023/11/postdoc-mines-andra-en.pdf
postdoc-mines-andra-en.pdf
Contact :mike.pereira@minesparis.psl.eu
POST-DOCTORAL position - Detection of neurovisual disorders on a driving simulator
Publiée le 31/01/2024 10:09.
Postdoc, 10-12 avenue de l'Europe 78140 Vélizy France.
Entreprise/Organisme :Laboratoire LISV / Université de Versailles Saint-Quentin (UVSQ)
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :December 1st, 2024
Durée du contrat :10 month
Rémunération :3036€ gross/month
Secteur d'activité :Psychology, neuroscience, biomedical engineering or a related data scientist field
Description :General description A 10-month post-doctoral position is available at the University of Versailles Saint-Quentin (UVSQ) in the LISV laboratory (www.lisv.uvsq.fr) headed by Professor Eric Monacelli. The post is part of the APTICONDUITE research project, which is part of the 'Interactive Robotics' research team. Project description The APTICONDUITE project aims to develop a new methodology integrated into a driving simulator for assessing neurovisual disorders of drivers in handicap situation. This project combines a new multimodal experimental approach with advanced statistical modelling to provide a new theoretical and practical angle for studying neurovisual diseases in the field of adaptive driving. In this context, the post-doctoral student will initially contribute to analyzing data from a network of physiological sensors on board a driving simulator. He/she will have to retrieve relevant information to characterize the driving performance of a specific population (stroke, cognitive disorders, etc.). The second stage will involve developing a new methodology for the early detection of neurovisual disorders using artificial intelligence algorithms, in order to improve current clinical assessments. The data set will include images, electrical signals and indicators such as heart rate, breathing rate, etc... Qualifications We are looking for a PhD with experience in cognitive science and data processing: - PhD: the candidate could hold a PhD in psychology, neuroscience, biomedical engineering or a related data scientist field. With: - Advanced skills in data analysis and the use of statistical software. - Practical experience with artificial intelligence methods, including the use of machine learning algorithms to analyze complex data. - Knowledge of visual disorders and their implications for driving would be appreciated.
En savoir plus :www.lisv.uvsq.fr
Post-doc1_APTICONDUITE_ENGLISH.pdf
Contact :olivier.rabreau@uvsq.fr
Internship Master 2 level in Geometric Statistics
Publiée le 08/01/2024 11:42.
Référence : Elena Di Bernardino.
Stage, Université Cote d'Azur Nice et Université de Lille.
Entreprise/Organisme :Laboratoire J.A. Dieudonné (Nice) et Laboratoire Paul Painlevé (Lille)
Niveau d'études :Master
Sujet :During this M2 Internship we will focus on the study of the robustness of the curvature measures estimators to a perturbation of the field X. Recently, Di Bernardino et al. (2022) focus on an isotropic Gaussian random field subject to perturbations of the variance and location of X. Di Bernardino et al. (2020) investigate LK curvatures for excursion sets of random fields on R^2 under a particular perturbation of X which consists in adding a zero mean spatial-invariant random perturbation. This type of perturbation can be seen as a small super-imposed noise to an underlining Gaussian field. The authors propose an estimator for the perturbation variance and prove it to be asymptotically normal and unbiased, allowing to make inference by using only the sparse information on the field given by their excursion sets. In this M2 Internship we aim at extending this analysis in the case of spatially varying random perturbations.
Date de début :During the second semester of the academic year 2023-2024
Durée du contrat :Between 4 and 6 months, during the second semester of the academic year 2023-2024.
Rémunération :Monthly gross salary : around 600euros
Description :In this internship we consider additive geometric measures that are the Lipschitz-Killing curvatures, denoted also referred to as intrinsic volumes or Minkowski functionals in the literature. The study of random fields through the geometry of their excursion sets has received a lot of interest. This is mainly stimulated by the applications in medical imaging domain (see for instance Adler and Taylor (2011), Section 5, and the references therein, Di Bernardino and Duval (2022)). This internship can lead to a Ph.D thesis (between October 2024 and October 2027) co-supervised by Elena Di Bernardino, Michele Ancona (Laboratory J.A. Dieudonné, Nice) and Céline Duval (Laboratory Paul Painlevé, Lille).
En savoir plus :https://math.univ-cotedazur.fr/~elenadb/
SujetM2.pdf
Contact :elenadb@unice.fr
Thèse - Self Supervised Learning pour la détection d'objets de petite taille
Publiée le 08/01/2024 11:42.
Thèse, Palaiseau.
Entreprise/Organisme :ONERA
Niveau d'études :Master
Date de début :01/10/2024
Durée du contrat :36 mois
Secteur d'activité :Aérospatial
Description :Thèse sur la détection d'objets de petite taille par SSL sur données multispectrales et temporelles avec quantification des incertitudes de prédiction
En savoir plus :www.onera.fr
DOTA-2024_thèse_SSL.pdf
Contact :sidonie.lefebvre@onera.fr
Inserm chair: Computational modeling for multi-omics data
Publiée le 04/12/2023 12:29.
Référence : CPJ COMPO.
CDD, Marseille.
Entreprise/Organisme :Inserm
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :09/2024
Durée du contrat :4 years
Rémunération :3 500€ - 5 000€ according to research experience
Secteur d'activité :Research and clinical oncology
Description :The generalization of new generation sequencing data (i.e., multi-omics: genomics, transcriptomics, proteomics,) as well as the emergence of new methods (single cell sequencing, spatial transcriptomics) opens new research horizons on cancer pathologies. These data, of very large dimensions and volume, bring new methodological challenges in terms of statistical and mathematical analysis, as well as computational modeling. The development and numerical implementation of novel methods has become a key issue in modern oncology, both in terms of understanding the biology of cancers and for medical oncology. On the first aspect, the analysis and modeling of these data is, for example, fundamental for the study of key phenomena such as intra- and inter-tumor heterogeneity of cancer cells and their microenvironment. On the other hand, the integration of multi-omics data into predictive artificial intelligence models will allow the development of precision medicine based on personalized treatments. This recruited researcher will aim at developing cutting-edge computational methods to leverage multi- omics and single-cell resolution data into novel and translational discoveries in cancer research. This will be performed in synergistic interaction with the other CRCM teams.
En savoir plus :https://eva3-accueil.inserm.fr/sites/eva/chaires/2024/Pages/Projets.aspx
Inserm_Projet_de_Chaire_2024_U1068_pr_aff.pdf
Contact :sebastien.benzekry@inria.fr
Offre de stage: Physics Informed Neural Networks for lake pollution forecast
Publiée le 22/11/2023 14:37.
Stage, Montpellier.
Entreprise/Organisme :MISTEA - INRAE
Niveau d'études :Master
Sujet :Teasing: The goal will be to build a fancy Machine Learning model that is aware of the laws of physics, a.k.a. Physics Informed Neural Networks (PINN), for a real life environmental application. In particular, we will try to combine generative models (like GANs & co) to time serie forecast with some imposed physics knowledge to get accurate forecast.
Durée du contrat :4-6 months
Rémunération :Gratification de stage environ 600€/mois
Description :The internship will take place in MISTEA unit. Contact me with your questions.
En savoir plus :https://mistea.montpellier.hub.inrae.fr/actualites/offre-de-stage-de-master-2024
offre_stage_PINN_MISTEA.pdf
Contact :david.metivier@inrae.fr
Statisticien / Gestionnaire de bases de données
Publiée le 20/10/2023 09:12.
Référence : Statisticien / Gestionnaire de bases de données (INSERM).
CDD, Maternité Port-Royal, 123 bd Port-Royal, 75 014 Paris.
Entreprise/Organisme :INSERM
Niveau d'études :Master
Date de début :01/02/2024
Durée du contrat :12 mois, renouvelable
Rémunération :A partir de 2494,30 euros brut mensuels, selon l’expérience et le niveau de formation
Secteur d'activité :Santé
Description :EPOPé est une équipe de recherche mixte de l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (INSERM) et de l’université Paris Cité, appartenant au Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique (CRESS). Nos recherches portent sur la santé des femmes pendant la grossesse et ses suites, la santé des enfants liée au contexte de la naissance et la santé des enfants en pédiatrie courante, en France et au niveau international. Au sein de l’équipe EPOPé, le/la statisticien(ne) travaille sur les données de 2 projets de recherche : - il/elle exploite les données, définit et met en oeuvre des analyses statistiques qui visent à développer, valider et analyser des indicateurs de santé relatifs aux femmes enceintes et aux nouveau-nés à partir des bases de données médico-administratives du Système National des Données de Santé (SNDS) (temps dédié : mi-temps) ; - il/elle participe à l’harmonisation de ces indicateurs au sein d’un réseau européen.il/elle exploite la base de données du registre des malformations congénitales de Paris (remaPAR) qui enregistre de manière continue, depuis 1981, tous les cas d’anomalies congénitales détectées en prénatal ou durant la première semaine de vie parmi les naissances vivantes, les mort-nés et les interruptions médicales de grossesse. Les objectifs principaux sont d’assurer la surveillance épidémiologique des anomalies congénitales, d’évaluer les pratiques et les politiques de santé, et de contribuer à la recherche étiologique (temps dédié : mi-temps).
En savoir plus :https://rh.inserm.fr/nous-rejoindre/Lists/Emploi%20ITA/Attachments/4415/U1153%20-%20CRESS%20-%20Stat
U1153- StatisticienSNDSREMAPAR_2024.pdf
Contact :isabelle.monier@inserm.fr

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