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PhD Position - Targer trial emulation - Grenoble
Publiée le 08/07/2025 12:47.
Thèse, Laboratoire HP2, U1300, Univ. Grenoble Alpes, Inserm - Faculté de Médecine, Grenoble.
Entreprise/Organisme :Université Grenoble Alpes
Niveau d'études :Master
Sujet :Exploring the impact of data sources and methodological choices on the estimation of drug efficacy through the emulated target trials framework
Date de début :November 2025
Durée du contrat :3 years
Rémunération :2200 € (brut)/month
Description :Project To access the market, the benefits of medications must be supported by solid evidence. Randomized controlled trials (RCTs) are considered the gold standard for producing such evidence because they provide a rigorous framework. Yet, increasing access to large databases and recent methodological advances such as target trial emulation offer new perspectives to produce valid causal inferences on the risk-benefit of medicines. The objectives of this project are to explore the feasibility of target trial emulation using different types of observational data (administrative vs. electronic health records) and to evaluate the heterogeneity of treatment effect estimates based on methodological choices. By better understanding the sources of variation in effect estimates between RCTs and emulated studies, this project will provide key insights into the reliability of these approaches in decision- making regarding the market approval and reimbursement of medications. Main activities Literature review and conception of target trials protocols, data management, data analysis, data reporting, and article writing. Skills Technical skills in data management and analysis (SAS or R) are required. Knowledge on causal inference, clinical research and drug development would be preferred, and previous experience with the French SNDS would be a great asset. Languages: French or fluent English reading, writing and speaking
En savoir plus :https://www.univ-grenoble-alpes.fr/
PhD Position_HP2_Roustit_Giai.pdf
Contact :matthieu.roustit@univ-grenoble-alpes.fr
Thèse CIFRE / Doctorant(e) en Statistiques (F/H)
Publiée le 30/06/2025 15:34.
Référence : Premista-983.
Thèse, Gondreville.
Entreprise/Organisme :Groupe PREMISTA
Niveau d'études :Master
Sujet :Modélisation statistique de la périodicité du mal-endettement
Durée du contrat :3 ans
Secteur d'activité :Intermédiation bancaire
Description :Développer des modèles statistiques et d'apprentissage automatique pour détecter des patterns temporels dans les données financières et comportementales (séries temporelles, clustering, modèles de survie). Analyser les cycles de mal-endettement (par exemple, saisonnalité, k-cycles) et leurs déterminants (type de crédit, événements de vie, etc.). Proposer des stratégies de relance adaptées aux périodes à risque identifiées, tout en respectant les contraintes éthiques et réglementaires (RGPD). Contribuer à la littérature académique sur l'endettement des ménages et ses implications socio-économiques.
En savoir plus :https://premista.jobs/postuler/Doctorant-Premista-983
Thèse CIFRE - Doctorant en Statistiques (F-H).pdf
Contact :credo.vovordassu@premista.fr
Learning high-dimensional (networked) dynamical systems from data
Publiée le 30/06/2025 15:34.
Référence : PhD NTU Singapore.
Thèse, Singapore.
Entreprise/Organisme :NTU Singapore
Niveau d'études :Master
Sujet :Learning high-dimensional (networked) dynamical systems from data
Secteur d'activité :Enseignement et Recherche
Description :Strong background in Probability/Statistics required with an interest in statistical learning problems -- especially from a theoretical perspective -- as evidenced by relevant coursework and projects See also other requirements (GRE, TOEFL etc.) and info listed here Before applying, you should first email Hemant Tyagi (hemant.tyagi@ntu.edu.sg) sufficiently in advance (with your CV) so that there is time to arrange for an interview in case your profile appears to be a good fit.
En savoir plus :https://hemant-tyagi.github.io/job_openings.html
Contact :hemant.tyagi@ntu.edu.sg
Proposition de sujet de thèse en biostatistique
Publiée le 30/06/2025 15:34.
Référence : Thèse en biostatistique - IDESP/UM.
Thèse, IDESP, Inserm/Université de Montpellier.
Entreprise/Organisme :Institut Desbrest d'Epidémiologie et de Santé Publique, Inserm/Université de Montpellier
Niveau d'études :Master
Sujet :Le biais de temps immortel dans les essais émulés : vers le développement de nouvelles approches statistiques
Date de début :01/10/2025
Durée du contrat :3 ans
Description :Cf. document pdf ci-joint
En savoir plus :https://idesp.umontpellier.fr/
Projet-these-2025_V2.pdf
Contact :mailis.amico@umontpellier.fr
Machine Learning pour l’exploration de la sous-dominance dans les génomes polyploïdes
Publiée le 18/06/2025 12:29.
Référence : Thèse en apprentissage statistique à l'université d'Angers.
Thèse, IRHS / LAREMA.
Entreprise/Organisme :Université d'Angers
Niveau d'études :Master
Sujet :cf. fichier joint
Date de début :01/10/2025
Durée du contrat :3 ans
Rémunération :base fonction publique
Secteur d'activité :Recherche
Description :cf. fichier joint
En savoir plus :https://rabier.github.io , https://blog.univ-angers.fr/panloup/ , https://irhs.angers-nantes.hub.in
SujetThese2025.pdf
Contact :charles-elie.rabier@univ-angers.fr
PhD thesis in environmental epidemiology
Publiée le 14/06/2025 13:12.
Référence : PhD thesis in environmental epidemiology.
Thèse, Rennes, France.
Entreprise/Organisme :INSERM/Irset
Niveau d'études :Master
Sujet :Early-life exposure to the urban environment and working memory development across childhood and adolescence in European birth cohorts
Durée du contrat :3 ans
Description :The project investigates how early-life urban exposures (e.g. green space, air pollution, noise) influence working memory trajectories from childhood to adolescence, using longitudinal data from multiple European birth cohorts. We are looking for candidates with a background in environmental epidemiology, public health, or related fields. Strong interest in quantitative methods is essential. Previous experience in neuroscience or neurodevelopmental research would be appreciated but is not mandatory.
En savoir plus :https://www.ehesp.fr/recherche/doctorat/reseau-doctoral/candidature-contrat-doctoral/
fiche-sujet-VA_ACB_BJ.pdf
Contact :anne-claire.binter@inserm.fr
PhD Position: Deep Generative Models of Physical Dynamics
Publiée le 11/06/2025 17:44.
Référence : PhD Position Deep Generative Models of Physical Dynamics, Sorbonne Université, Paris,.
Thèse, Paris.
Entreprise/Organisme :Sorbonne Universite, Institut des Systèmes Intelligents et de Robotique (ISIR)
Niveau d'études :Master
Sujet :Abstract: AI4Science is an emerging field investigating the potential of AI to advance scientific discovery, with deep learning playing a central role in modeling complex natural phenomena. Within this context, deep generative modeling—which already enables the synthesis of high-dimensional data across modalities such as text, images, and audio—is now opening new avenues for simulating and understanding complex physical systems. This PhD project aims to explore and advance generative deep learning architectures—such as diffusion models, flow-matching networks, and autoregressive transformers—for modeling complex physical dynamical systems arising in domains such as climate, biology, and fluid mechanics. These models hold strong potential for learning flexible, data-driven representations of physical laws. By developing generalizable, cross-physics generative models, this research contributes to the broader vision of AI4Science: accelerating scientific discovery through learned simulation and abstraction.
Date de début :November or December 2025
Durée du contrat :36 mois
Rémunération :2200 per Month Gross Salary + possible teaching vacations
Secteur d'activité :Computer Science, Artificial Intelligence, Machine Learning
Description :This PhD project aims to explore and advance generative deep learning architectures—such as diffusion models, flow-matching networks, and autoregressive transformers—for modeling complex physical dynamical systems arising in domains such as climate, biology, and fluid mechanics. These models hold strong potential for learning flexible, data-driven representations of physical laws. By developing generalizable, cross-physics generative models, this research contributes to the broader vision of AI4Science: accelerating scientific discovery through learned simulation and abstraction. Research Objectives The overarching research question is: Can we develop generative models that learn structured, physically grounded representations of dynamical systems—enabling synthesis, adaptation, and generalization across physical regimes and multiphysics settings? It unfolds into several complementary directions: Latent Generative Models for Physical Dynamics The objective is to design generative models—such as diffusion, flow-matching, or autoregressive models—that learn compact and interpretable latent representations of spatiotemporal dynamics governed by PDEs. These models should: • Capture uncertainty and multimodality in solution trajectories. • Generalize across parametric variations. Learning Across Multiphysics Systems To enable transfer learning across heterogeneous physics, we will explore shared latent representations across families of PDEs: • Using encode–process–decode frameworks. • Applying contrastive or multitask training to uncover reusable physical abstractions. • Designing models invariant to space/time resolution and units. This direction builds toward foundation-like models that capture generalizable physics priors across simulation families. Few-Shot and In-Context Generalization to New Physics To support scientific modeling in data-scarce settings, we will develop methods for few-shot generalization such as: • Fine-tuning latent priors to new PDE systems using limited examples. • Exploring meta-learning and prompt-based adaptation techniques (inspired by in-context learning in language models). • Incorporating known physical constraints into the generative process. The goal is to enable rapid and physically consistent adaptation to previously unseen dynamics with minimal data and supervision. Position and Working Environment The PhD studentship is a three years position starting in October/November 2025. It does not include teaching obligation, but it is possible to engage if desired. The PhD candidate will work at Sorbonne Université (S.U.), in the center of Paris. He/She will integrate the MLIA team (Machine Learning and Deep Learning for Information Access) at ISIR (Institut des Systèmes Intelligents et de Robotique). References Chen, W., Song, J., Ren, P., Subramanian, S., Morozov, D., & Mahoney, M. W. (2024). Data-Efficient Operator Learning via Unsupervised Pretraining and In-Context Learning. 1–21. http://arxiv.org/abs/2402.15734 Hao, Z., Su, C., Liu, S., Berner, J., Ying, C., Su, H., Anandkumar, A., Song, J., & Zhu, J. (2024). DPOT: Auto-Regressive Denoising Operator Transformer for Large-Scale PDE Pre-Training. Icml. http://arxiv.org/abs/2403.03542 Kassai Koupai, A., Benet, J. M., Yin, Y., Vittaut, J.-N., & Gallinari, P. (2024). GEPS: Boosting Generalization in Parametric PDE Neural Solvers through Adaptive Conditioning. NeurIPS. https://geps-project.github.io/ Kirchmeyer, M., Yin, Y., Donà, J., Baskiotis, N., Rakotomamonjy, A., & Gallinari, P. (2022). Generalizing to New Physical Systems via Context-Informed Dynamics Model. ICML. McCabe, M., Blancard, B. R.-S., Parker, L. H., Ohana, R., Cranmer, M., Bietti, A., Eickenberg, M., Golkar, S., Krawezik, G., Lanusse, F., Pettee, M., Tesileanu, T., Cho, K., & Ho, S. (2024). Multiple Physics Pretraining for Physical Surrogate Models. 1–25 http://arxiv.org/abs/2310.02994 Serrano, L., Wang, T., le Naour, E., Vittaut, J.-N., & Gallinari, P. (2024). AROMA : Preserving Spatial Structure for Latent PDE Modeling with Local Neural Fields. NeurIPS. Serrano, L., Kassai, A., Wang, T., Erbacher P., Gallinari, P., (2025) Zebra: In-Context Generative Pretraining for Solving Parametric PDEs. Zhou, A., Li, Z., Schneier, M., Buchanan Jr, J. R., & Farimani, A. B. (2025). TEXT2PDE: Latent Diffusion Models for Accessible Physics Simulation. ICLR.
En savoir plus :https://pages.isir.upmc.fr/gallinari/open-positions/
2025-05-01-PhD-Description-Generative-models-Physics.pdf
Contact :patrick.gallinari@sorbonne-universite.fr
Depth functions and voting methods; towards a unifying approach
Publiée le 11/06/2025 17:43.
Référence : Thèse projet CONDORCET.
Thèse, grenoble.
Entreprise/Organisme :Université Grenoble Alpes
Niveau d'études :Master
Sujet :Cette thèse s’inscrit dans le cadre du projet CONDORCET, qui vise à renouveler l’analyse des règles de vote en s’appuyant sur des outils mathématiques robustes et interprétables. Elle explore l’écriture des modes de vote comme résultat d'un problème d'optimisation. Basé sur des fonctions de profondeur statistique, cette approche permet de définir, analyser et comparer les méthodes de vote
Description :This thesis is part of the CONDORCET project, which aims to renew the analysis of voting rules using robust and interpretable mathematical tools. It explores the writing of voting modes as the result of an optimization problem. Based on statistical depth functions, this approach makes it possible to define, analyze and compare voting methods. Cette thèse s’inscrit dans le cadre du projet CONDORCET, qui vise à renouveler l’analyse des règles de vote en s’appuyant sur des outils mathématiques robustes et interprétables. Elle explore l’écriture des modes de vote comme résultat d'un problème d'optimisation. Basé sur des fonctions de profondeur statistique, cette approche permet de définir, analyser et comparer les méthodes de vote.
En savoir plus :https://adum.fr/as/ed/voirproposition.pl?langue=&matricule_prop=66384&site=edmstii
Contact :antoine.rolland@univ-lyon2.fr
PHD POSITION IN DEVELOPMENTAL COGNITIVE NEUROSCIENCE & DATA SCIENCE
Publiée le 20/05/2025 13:31.
Thèse, Paris.
Entreprise/Organisme :Université Paris Cité
Niveau d'études :Master
Sujet :Preterm birth affects approximately one in ten children globally and presents significant developmental risks. This PhD project proposes an interdisciplinary approach, combining neuroscience, developmental psychology, and advanced data science methods, to study premature children's developmental trajectories. The project has three main objectives: (1) identify distinct multilevel profiles in premature children aged 9–10 using genetic, brain, cognitive, and behavioral data through sophisticated machine learning techniques (including recurrent neural networks and temporal convolutional networks); (2) analyze their developmental trajectories to age 15 using latent class mixed models (LCMM); and (3) determine predictive factors through multivariate statistical analysis. Drawing on the ABCD® study cohort of over 10,000 children (including 2,000 premature), this research will leverage state-of-the-art statistical methods and machine learning models to deepen our understanding of preterm-born children's development. Clinically, identifying risk and protective factors through these advanced analytical approaches will guide the development of personalized early interventions. The innovative data science methodology developed during this PhD could also be adapted to various clinical applications.
Date de début :October 1, 2025
Durée du contrat :3 years
Description :Applications are invited for a 3-year PhD position starting October 1st, 2025, to study preterm-born children's developmental trajectories. The project will adopt an interdisciplinary approach combining neuroscience, developmental psychology, and data science. The PhD candidate will be funded by the CNRS through the MITI (Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires) for 3 years to complete the project. The candidate will be based at the LaPsyDÉ Lab (https://www.lapsyde.com/, CNRS UMR 8240, Université Paris Cité) at La Sorbonne in Paris, France and will collaborate with Edouard Duchesnay, GAIA Brain Imaging and Data Science Lab (https://gaia.neurospin.fr/, CNRS UMR 9027, CEA) at Neurospin center in Saclay.
En savoir plus :https://sites.google.com/view/irismenu/phd-position-in-developmental-cognitive-neuroscience-and-data
PHD_OFFER_MITI.pdf
Contact :iris.menu@u-paris.fr
Evaluation de l’influence du paysage sur le risque acarologique : approche par modélisation
Publiée le 12/05/2025 18:07.
Référence : Thèse tiques et paysage INRAE Nantes.
Thèse, INRAE (unité BIOEPAR), Nantes.
Entreprise/Organisme :INRAE
Niveau d'études :Master
Sujet :Evaluation de l’influence de la connectivité entre les éléments boisés du paysage sur le risque acarologique : approche par modélisation L’émergence des maladies animales et zoonotiques transmises par les tiques est influencée par des interactions complexes entre les tiques, les agents transmis, les hôtes réservoirs vertébrés et leurs habitats. Les changements de composition du paysage peuvent modifier fortement les rapports entre les espèces et l’abondance des populations, jouant ainsi sur le « risque acarologique », défini par la densité de tiques infectées par un agent pathogène. Ce travail vise à une réflexion méthodologique approfondie sur la façon de modéliser l’influence du degré de fragmentation des paysages agricoles bocagers sur le risque acarologique dans des espaces boisés, sur l’exemple des bactéries du genre Borrelia, agents de la maladie de Lyme. Des analyses statistiques bayésiennes sur des jeux existants de données observées et paysages réels permettront d’identifier les variables influençant le risque dans des habitats boisés d’un paysage bocager. Ces variables seront intégrées dans un modèle dynamique reposant sur le couplage entre un modèle de paysage et un modèle de transmission de bactéries au sein de populations de tiques. Développé dans un cadre conceptuel de métapopulations, ce modèle permettra d’explorer des scénarios d’une manière théorique et par confrontation avec les données, notamment sur l’influence respective des caractéristiques des éléments boisés (taille, composition) et de leur agencement dans l’espace.
Date de début :01/11/2025
Durée du contrat :3 ans
Rémunération :2200€ brut /mois
Description :"Evaluation de l’influence de la connectivité entre les éléments boisés du paysage sur le risque acarologique : approche par modélisation" Cette thèse sera co-encadrée par Thierry Hoch, Suzanne Bastian (tous de l'UMR Oniris-INRAE BIOEPAR, Santé Animale) et Emily Walker (UR INRAE BIOSP, Mathématiques et Numérique). Le descriptif du projet est disponible sur le site de candidature de l'Ecole Doctorale : https://amethis.doctorat.org/amethis-client/prd/consulter/offre/1626 La date limite de candidature est fixée au 10 juin 2025.
En savoir plus :https://amethis.doctorat.org/amethis-client/prd/consulter/offre/1626
Contact :thierry.hoch@inrae.fr
PREDICTION OF SHORT-TERM READMISSIONS AFTER HOSPITALIZATION FOR ACUTE INFECTION
Publiée le 05/05/2025 09:50.
Référence : Thèse.
Thèse, Institut Pasteur Paris.
Entreprise/Organisme :Inserm
Niveau d'études :Master
Sujet :La réadmission dans les suites proches d’une hospitalisation est associée à une morbidité (incluant une durée de séjour prolongée et des coûts associés) et une mortalité accrue. Elle concerne environ 5% de l’ensemble des patients hospitalisés. Si de nombreux facteurs peuvent intervenir dans le taux de réadmission, notamment liés à l’âge et aux pathologies associées mais aussi des facteurs extérieurs tels que la pression sur la demande d’hospitalisation (par exemple en période d’épidémies hivernales ou de vacances) une part de celui-ci est probablement évitable et il a été suggéré que ce taux pouvait être utilisé comme marqueur de la qualité des soins. Plus concrètement, disposer d’un modèle permettant de prédire la probabilité de réadmission pourrait fournir au praticien une aide à la décision de sortie d’un malade lorsqu’elle est envisagée et/ou à la prise en charge dans les suites immédiates post-hospitalisation (i.e.suivi et consultation précoce post-hospitalisation, rééducation, etc.). Ce projet s’intéressera à une pathologie spécifique, la pathologie infectieuse aigue d’origine bactérienne, pour laquelle il est attendu un contrôle de l’infection au cours de la prise en charge hospitalière initiale et un taux de réadmission modéré, représentant ainsi un domaine dans lequel le taux de réadmission pourrait être plus directement lié à la qualité de la prise en charge que dans d’autres spécialités. Un modèle prédictif sera construit, il utilisera les données PMSI du patient, du séjour index et des séjours antérieurs et des variables proxy de la pression extérieure pour prédire le risque de réadmission. On s’intéressera également spécifiquement au sous-groupe de patients les plus graves, transférés en réanimation, pour lesquels la réadmission précoce (d’un service d’aval avec retour en réanimation) peut être un marqueur de la survenue de complications aggravant le pronostic. L’identification des admissions potentiellement évitables permettront de comparer pour une période donnée les taux de réadmission observés et estimés par le modèle et par-delà identifier les structures pour lesquelles le gain serait important.
Date de début :Octobre ou novembre 2025
Durée du contrat :3 ans
Rémunération :2 077,41 € brut mensuel (contrat doctoral)
Secteur d'activité :Santé publique, biostatistique
Description :Voir document joint 1) Développer et évaluer un algorithme de prédiction des ré-hospitalisations suivant une première hospitalisation pour infection aiguë. 2) Développer et évaluer un algorithme de prédiction spécifique aux réadmissions précoces en réanimation suivant une première admission en réanimation durant une hospitalisation pour infection bactérienne aiguë. 3) Estimer la proportion de ré-hospitalisations évitables.
En savoir plus :https://research.pasteur.fr/fr/member/laurence-watier/
SFdS_PRIA_20250430.pdf
Contact :laurence.watier@pasteur.fr
Clustering de valeurs extrêmes sur des séries chronologiques
Publiée le 25/04/2025 09:24.
Référence : Thèse en Statistique.
Thèse, Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique (UMR CNRS Vannes) et ALDECIS.
Entreprise/Organisme :Université Bretagne Sud et ALDECIS
Niveau d'études :Master
Sujet :Clustering de valeurs extrêmes sur des séries chronologiques
Date de début :septembre 2025
Durée du contrat :3 années
Rémunération :2400€ brut mensuel + frais de transport (dont ceux vers les bureaux d’Aldecis)
Secteur d'activité :Statistique
Description :L'objectif est de développer une procédure statistique automatique de détection des anomalies extrêmes, s’inscrivant dans une approche combinant apprentissage automatique (Machine Learning) et apprentissage profond (Deep Learning). Cette méthode aura pour objectif d’identifier les observations atypiques et de les regrouper en clusters selon leurs similarités structurelles, en vue de mutualiser l’application cohérente de traitements correctifs ciblés et de proposer des mesures préventives (soit par risques de propagation, soit par faiblesses structurelles identiques).
En savoir plus :http://web.univ-ubs.fr/lmba/durrieu/CV/Annonce_THESE.pdf
Contact :gilles.durrieu@univ-ubs.fr
PhD in modeling of soils
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : DeepHorizon.
Thèse, AgroParisTech , Palaiseau.
Entreprise/Organisme :UMR MIA, AgroParisTech
Niveau d'études :Master
Sujet :Developing a statistical spatial soil inference system with quantified uncertainty
Date de début :march 2025 or later
Durée du contrat :3 years
Rémunération :monthly gross salary ~ 2,100 €
Secteur d'activité :Interdisciplinary research in statistical machine learning and environmental sciences
Description :In the framework of the EU-project DeepHorizon (https://cordis.europa.eu/project/id/101156701), we are looking for an excellent PhD candidate to develop statistical methods supporting the development of a spatial soil inference system for European soils. A soil inference system uses known measurements, each with a certain level of uncertainty, to predict related soil properties with minimal error, by applying a series of logically connected (pedo)transfer functions (PTFs). The PhD candidate will start with an inventory of existing soil pedotransfer functions relevant to European soils and to calibrate usual mechanistic biogeochemical models. A large part of the work involves the exploration, development and application of new statistical approaches relevant for the inference system. The approaches should handle missing data along with uncertainty quantification of the input soil properties and propagation of the uncertainty throughout the inference engine. The candidate is expected to collaborate closely with other PhD candidates of the project consortium and with a project partner in Belgium, for which temporary stay could be envisioned.
En savoir plus :https://cordis.europa.eu/project/id/101156701
PhD_topic_PTFs.pdf
Contact :tabea.rebafka1@agroparistech.fr
Clustering de données fonctionnelles avec application en océanographie
Publiée le 01/10/2024 09:26.
Référence : Clustering de données fonctionnelles avec application en océanographie.
Thèse, Conservatoire National des Arts et Métiers, 2 rue Conté 75003 Paris.
Entreprise/Organisme :Conservatoire National des Arts et Métiers, Laboratoire CEDRIC
Niveau d'études :Master
Sujet :Classification non-supervisée pour l'identification de paysages acoustiques homogènes
Date de début :Entre fin 2024 et début 2025 en fonction de la date de recrutement du candidat
Durée du contrat :3 ans
Secteur d'activité :recherche
Description :Voir pièce jointe
En savoir plus :https://vincentaudigier.weebly.com/uploads/1/7/3/1/17317324/these_cnam_shom_clustering.pdf
these_cnam_shom_clustering.pdf
Contact :vincent.audigier@cnam.fr
 
 
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