Stage, Ile de la Réunion.| Entreprise/Organisme : | CIRAD | | Niveau d'études : | Master | | Sujet : | Analyse des interactions entre croissance végétative et reproduction chez le manguier et effets du système de culture | | Date de début : | entre février et avril 2019 | | Durée du contrat : | 6 mois | | Rémunération : | selon réglementation en vigueur (environ 550€ par mois) | | Secteur d'activité : | Recherche agronomique | | Description : | Mots clés : analyse de données, architecture de l’arbre, croissance végétative, floraison, fructification, GLM, GLMM, LM, logiciel R
Structure d’accueil
Le Cirad, Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement, est un organisme scientifique spécialisé en agriculture dans les régions tropicales et subtropicales. Il a pour mission de contribuer au développement agricole des pays chauds par des recherches, des réalisations expérimentales, la formation et l’information scientifique et technique. Le stage se déroulera au sein de l’unité de recherche HortSys (https://ur-hortsys.cirad.fr/) à La Réunion.
Contexte de l'étude
L’unité de recherche HortSys travaille, entre autres, sur la durabilité des systèmes de production de fruitiers tropicaux et en particulier du manguier. Pour cette espèce, des travaux sont réalisés pour mieux comprendre les interactions entre la croissance végétative et la floraison et la fructification, et les effets de l’environnement et des pratiques culturales sur ces interactions.
Dans le cadre d’activités de coopération scientifique internationale, l’unité de recherche HortSys collabore depuis 2014 avec l’équipe de Ian Bally sur la station de Mareeba du Queensland Department of Agriculture and Fisheries (QDAF) en Australie. Cette équipe conduit une expérimentation de grande envergure sur la conduite du manguier en haute densité, combinant comme facteurs trois variétés, trois densités de plantation et deux modes de conduite de l’arbre. Des données décrivant la croissance végétative, la floraison et la fructification ont été acquises de façon exhaustive sur certains arbres durant trois années.
Objectif et déroulement du stage
L’objectif du stage est d’analyser ces données avec des outils et méthodes statistiques adaptés, afin notamment de mettre en évidence les interactions entre la croissance végétative et la floraison/fructification, et les effets des facteurs de l’essai sur ces interactions.
Ces analyses s’appuieront sur l’expérience acquise dans l’équipe d’accueil et en Australie. Le stage sera découpé en différentes étapes :
- Prise en main de la base de données, du vocabulaire et des concepts biologiques, et des questions de recherche ;
- Extraction à partir des données brutes de variables d’intérêt pour les analyses (code R existant et à développer) ;
- Analyse des données et mise en forme des résultats ;
- Rédaction du mémoire de stage.
Les variables à analyser sont des variables binaires, de comptage, multinomiales, gaussiennes. Les outils statistiques privilégiés sont le modèle linéaire, les modèles linéaires généralisés et les modèles linéaires généralisés mixtes.
L’encadrement sera assuré par Frédéric Normand, chercheur agronome fruitier Cirad HortSys, et Carole Wright, biométricienne QDAF.
Profil de l’étudiant(e) :
- Etudiant(e) en statistiques avec un goût prononcé pour la biologie et l’agronomie, ou étudiant en biologie ou agronomie avec de solides connaissances en statistiques ;
- Aptitude à travailler en équipe pluridisciplinaire (agronome, statisticien) ;
- Maitrise du logiciel R ;
- Bonne pratique de la langue anglaise.
Conditions de stage:
Billet d’avion pris en charge, indemnité mensuelle selon les textes en vigueur (environ 550€), tickets restaurant, logement fourni par le Cirad (participation aux frais de 80€ par mois). | | En savoir plus : | https://ur-hortsys.cirad.fr/ | | Contact : | frederic.normand@cirad.fr |
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