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Apprentissage et suivi dynamique de comportements à partir de données urbaines
Publiée le 23/09/2021 09:10.
Référence : Postdoc - Analyse de données urbaines.
Postdoc, Champs-sur-Marne.
Entreprise/Organisme :Université Gustave Eiffel, laboratoire GRETTIA
Niveau d'études :Doctorat
Durée du contrat :12 à 18 mois
Description :L'objectif de ce postdoc est de développer une méthodologie générique d'apprentissage statistique, qui permette d'une part d'identifier des patterns caractérisant les principaux comportements en matière de mobilité et de consommation d'énergie, et d'autre part, de modéliser la dynamique d’évolution de ces comportements dans le temps. Les données à analyser seront issues de validations de cartes de transport en commun (billettique) et de mesures de la consommation d’énergie dans des parcs de logements. En plus de décrire de manière synthétique ces données urbaines massives, les travaux visent aussi à détecter et à prévoir des changements dans les habitudes de déplacement et de consommation. Dans le contexte actuel, il sera par exemple intéressant de caractériser les changements d’habitudes de déplacement et de consommation liés à crise sanitaire.
En savoir plus :https://www.grettia.ifsttar.fr/linstitut/cosys/laboratoires/grettia/
postdoc_grettia.pdf
Contact :allou-badara.same@univ-eiffel.fr
Chargé(e) d’études scientifiques
Publiée le 22/09/2021 11:36.
Référence : DMNTT-CDD-2021.
CDD, Saint-Maurice (94).
Entreprise/Organisme :Santé publique France
Niveau d'études :Master
Date de début :Dès que possible
Durée du contrat :12 mois
Secteur d'activité :Santé publique
Description :Le chargé d’études scientifiques aura deux missions principales : - Contribuer à l’évaluation de la performance des programmes nationaux de dépistage organisé des cancers ; - Participer aux études de l’unité cancer sur les inégalités de santé, les populations vulnérables, l’impact de l’épidémie de COVID-19 sur les cancers.
En savoir plus :https://www.santepubliquefrance.fr/offres-d-emploi/charge-e-d-etudes-scientifiques3
DMNTT-CDD-2021-11.pdf
Contact :marie-christine.morel@santepubliquefrance.fr
Statisticien
Publiée le 21/09/2021 11:25.
CDD, Département d'Epidémiologie Biostatistiques et Information médicale.
Entreprise/Organisme :CHU Montpellier
Niveau d'études :Master
Durée du contrat :CDD à évolution possible
Secteur d'activité :Santé publique
Description :Statisticien en CHU, dans le domaine de l'épidémiologie et l'évaluation Hospitalière
En savoir plus :Montpellier
Fiche_poste_Statisticien_2021.pdf
Contact :f-seguret@chu-montpellier.fr
Post-Doctorat en Biostatistique
Publiée le 17/09/2021 10:35.
Référence : RndForNets-SESSTIM-21.
CDD, MARSEILLE.
Entreprise/Organisme :Université Aix-Marseille
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :Dès que possible
Durée du contrat :12 mois
Rémunération :2 466 € à 2 891 € bruts mensuels
Secteur d'activité :Faculté des sciences médicales et paramédicales
Description :Dans le cadre du projet « Development and added value of boosting with penalized splines and random forests in excess mortality hazard models applied to cancer epidemiology » financé par l’INCa, nous nous intéressons à l’apport d’approches issues de l’apprentissage automatique dans l’analyse de la survie nette à partir de données de registres enrichies par des données issues d’autres sources. Activités principales - Développer ou adapter une méthodologie basée sur des forêts aléatoires pour estimer la survie nette - Intégrer une approche de sélection des covariables informatives dans un contexte de grande dimension ; - Evaluer ces méthodes via des études par simulations ; - Implémenter l’ensemble dans un paquet R ; - Rédiger les publications.
En savoir plus :https://sesstim.univ-amu.fr/page/sesstim
OffreEmploi-PostDoc-Random-Forest-Net-Survival-2021.pdf
Contact :sesstim-secretariat@univ-amu.fr
Biostatisticien Recherche Translationnelle
Publiée le 17/09/2021 09:07.
Référence : BIOSTATTRANSLA.
Postdoc, Toulouse.
Entreprise/Organisme :Institut Claudius Regaud. IUCT-O
Niveau d'études :Master
Date de début :Dès que possible
Durée du contrat :12 Mois renouvelable
Secteur d'activité :Centre de Lutte Contre le Cancer / Recherche Clinique et Translationnelle
Description :L’Institut Claudius Regaud, Centre de Lutte Contre le Cancer de la région Midi-Pyrénées au sein de l’Institut Universitaire du Cancer Toulouse Oncopôle (IUCT-O), campus de recherche en cancérologie d’envergure européenne, est promoteur d’essais thérapeutiques (Phase I à III) et de recherches translationnelles en cancérologie. L’Institut prend en charge les aspects méthodologiques des projets. Missions: Développer et exploiter les bases de données des études translationnelles et cliniques. Réaliser les analyses statistiques des études translationnelles et cliniques Principales activités:  Participer à l’élaboration des protocoles  Programmer les analyses statistiques des études cliniques, des données de biomarqueurs mais aussi potentiellement des données de grandes dimensions nécessitant des méthodes spécifiques  Réaliser les analyses et rapports statistiques des études translationnelles et cliniques,  Travailler en étroite collaboration avec les équipes cliniques et de recherche translationnelle
En savoir plus :www.iuct-oncopole.fr
profil_biostati_transla.pdf
Contact :filleron.thomas@iuct-oncopole.fr
Post doctoral position in statistics
Publiée le 17/09/2021 09:07.
Référence : Post doctoral position in statistics.
Postdoc, Tours.
Entreprise/Organisme :INSERM SPHERE U1246 University of Tours
Niveau d'études :Doctorat
Durée du contrat :18 mois
Description :The post-doctoral researcher will work specifically on measures of clustering for time-to-event outcomes in cluster randomised trials. This will include analytical developments and simulations. The position will include teaching activity and a master’s thesis supervision. The position will be based in the office space of the SPHERE unit in the teaching hospital of Tours. The applicant will have his/her own office with an adequately powered computer.
En savoir plus :https://sphere-inserm.fr/
Post_doctoral_researcher_position_V20210913_VF.pdf
Contact :agnes.caille@univ-tours.fr
Offre de thèse, projet IA4stresslife
Publiée le 17/09/2021 09:06.
Référence : IA4stressLife.
Thèse, Dijon.
Entreprise/Organisme :AgroSup Dijon
Niveau d'études :Master
Sujet :In the framework of the interdisciplinary research project IA4stresslife, funded by Agrosup Dijon, a three years PhD position is open. This project aims to introduce artificial intelligence approaches in food engineering processes. The PhD project will focus on controlling a production line, of living cells submitted to a stress, through microscopic imaging and data assimilation/modelling/control of the line. The PhD candidate will be part of the PAM laboratory, Food and Wine Science & Technology (joint between AgroSup Dijon and university of Bourgogne https://www.umr-pam.fr/fr/equipes-de-umr-pam/pmb.html), Microbiological and Biotechnological Processes team.
Date de début :1.12.2021
Durée du contrat :3 ans
Secteur d'activité :Enseignement supérieur et recherche
Description :Une thèse de doctorat en ** modélisation mathématique/statistique/simulation stochastique ** et son financement (AgroSup Dijon et Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation) sont proposés au sein du laboratoire UMR Procédés alimentaires et microbiologiques de DIJON, équipe PMB (procédés microbiologiques et biotechnologiques). https://www.umr-pam.fr/fr/equipes-de-umr-pam/pmb.html Le contrat débutera dès que possible. L'objectif est de travailler, au sein du projet de recherche IA4stresslife, sur le thème : Modélisation augmentée par l’intelligence artificielle afin de comprendre et de contrôler, via l’imagerie microscopique, le processus de déshydratation de micro-organismes de type levures. Préférentiellement les profils recherchés sont de type master en mathématiques appliquées/statistique/data science/ML avec un intérêt prononcé pour les applications en microbiologie en lien avec l'agro-alimentaire. Si vous êtes intéressés, merci de prendre contact, en joignant un CV, noms de personnes/mel pouvant recommander votre candidature, pièce d'identité, diplôme de master ou attestation, relevé de notes M1/M2, mémoire de master le plus rapidement possible avec - Pierre-Yves LOUISpierre-yves.louis@math.cnrs.fr ;pierre-yves.louis@agrosupdijon.fr laboratoire Procédés alimentaires et microbiologiques de Dijon, AgroSup Dijon et Institut de Mathématiques de Dijon - Laurence DUJOURDYlaurence.dujourdy@agrosupdijon.fr Service d’Appui à la recherche en science des données, AgroSup Dijon - Ludovic JOURNAUXludovic.journaux@agrosupdijon.fr Laboratoire informatique de Bourgogne et AgroSup Dijon Bien cordialement, Pierre-Yves LOUIS http://pylouis.perso.math.cnrs.fr/
En savoir plus :https://www.umr-pam.fr/fr/equipes-de-umr-pam/pmb.html
PhD-position-AgroSupDijon-1.pdf
Contact :pierre-yves.louis@agrosupdijon.fr
Data manager-Biostatisticien SNDS
Publiée le 09/09/2021 20:34.
Référence : LW.
CDD, Institut Pasteur, Paris.
Entreprise/Organisme :Inserm
Niveau d'études :Master
Date de début :Au plus tôt
Durée du contrat :12 à 18 mois
Rémunération :Selon les grilles de la fonction publique et l’expérience
Description :Le projet s’appuie sur les données individuelles du système national des données de santé (SNDS), qui regroupe les soins hospitaliers et les soins de ville remboursés. A partir des données hospitalières les patients hospitalisés pour COVID-19 pendant la première vague seront identifiés. Une attention particulière sera portée à ceux présentant une pathologie respiratoire chronique.
En savoir plus :https://research.pasteur.fr/en/member/laurence-watier/
Biostatisticien_CDD 20210909.pdf
Contact :laurence.watier@inserm.fr
Inférence dans les modèles à copules pour données non continues par vraisemblance par paires randomi
Publiée le 08/09/2021 17:44.
Stage, Jouy-en-Josas.
Entreprise/Organisme :INRAE, unité MaIAGE
Niveau d'études :Master
Sujet :Inférence dans les modèles à copules pour données non continues par vraisemblance par paires randomisée avec applications en biologie "-omique"
Date de début :01/04/2022
Durée du contrat :5 à 6 mois
Rémunération :550 EUR / mois
Secteur d'activité :Mathématique et statistique
Description :TITRE (ENGLISH BELOW) Inférence dans les modèles à copules pour données non continues par vraisemblance par paires randomisée avec applications en biologie "-omique" SUJET Une copule est une fonction qui prend en arguments des fonctions de répartition univariées arbitraires et retourne une fonction de répartition multivariée. Au vu du caractère arbitraire des lois choisies en entrée, la loi multivariée en sortie, appelée modèle à copules, peut donc modéliser tous types de données (discrètes, continues et mixtes). Cette propriété avantageuse des modèles à copules en font de bons candidats pour traiter les données de type "-omiques" en biologie, dont l'analyse permet de mieux comprendre le lien entre génotype et phénotype. Néanmoins, les données -omiques sont souvent de nature discrète (par exemple, on compte le nombre de fragments d'ARN qui correspondent à un gène donné pour révéler son niveau d'expression dans une condition donnée), ce qui rend l'inférence statistique difficile à cause de la complexité algorithmique du calcul de la vraisemblance. Pour résoudre ce problème, une méthode du maximum de la vraisemblance par paires randomisée a été récemment proposée. Des résultats théoriques (consistence et normalité asymptotique des estimateurs) et numériques encourageants ont été obtenus, et une analyse de données de type RNA-seq a été réalisée dans un cadre simple. L'objectif de ce stage est d'étendre cette méthode à des cadres à plus fort enjeux en biologie, comme l'inférence de réseaux de régulation à partir de données multi-omiques mixtes. CANDIDAT Le stagiaire, issu d'un master 2 recherche en mathématique et/ou statistique, écrira le modèle statistique et la méthode d'inférence, étudiera leurs propriétés théoriques et validera l'approche proposée sur simulations et un jeux de données de type multi-omique produit à l'INRAE. Sous réserve d'obtention de financements, le stage pourra déboucher sur une thèse de doctorat. ENCADREMENT Gildas Mazo (INRAE, UR1404 MaIAGE) et Florence Jaffrézic (INRAE, UMR1313 GABI) DEROULEMENT DU STAGE Le stage se déroulera dans l'unité MaIAGE (Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l’Environnement) du centre INRAE de Jouy-en-Josas (78350). La durée prévue est de 5 à 6 mois. Gratification : 550 euros/mois environ (taux légal). CANDIDATURE Envoyer une lettre de motivation, votre CV et la liste des cours suivis en M1/M2 avec toutes les notes disponibles à gildas.mazo@inrae.fr et/ou florence.jaffrezic@inrae.fr. =================================================================== TITLE Inference in copula models for non-continuous data by the randomized pairwise likelihood method with applications to "-omics" biology. TOPIC A copula is a function that takes arbitrary cumulative distribution functions as inputs and outputs a multivariate distribution function. Since the input distributions are arbitrary, the multivariate output distribution, called a copula model, can model all types of data (discrete, continuous and mixed). This advantageous property of copula models makes them good candidates to deal with "-omics" data in biology, the analysis of which allows to better understand the link between genotype and phenotype. However, -omics data are often discrete (for instance, one counts the number of RNA fragments that match a given gene to discover its expression level at a given condition), which makes statistical inference difficult due to the algorithmic complexity of the likelihood. To overcome this issue, a method based on a randomized pairwise likelihood was recently proposed. Encouraging theoretical (consistency and asymptotic normality of the estimator) and numerical results were obtained, and a RNA-seq data analysis was performed in a simple framework. The goal of this internship is to extend this method to more ambitious settings in biology, as the inference of regulation networks from mixed multi-omics data. CANDIDATE The internship student, from a "master 2" in mathematics and/or statistics, will write the statistical model and the inference method, study their theoretical properties, and validate the approach on simulations and a multi-omics dataset from INRAE. Upon funding, the internship can lead to a PhD. SUPERVISION Gildas Mazo (INRAE, UR1404 MaIAGE) and Florence Jaffrézic (INRAE, UMR1313 GABI) INTERNSHIP The internship will take place in the MaIAGE ("Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l’Environnement") unit of the "Jouy-en-Josas" (78350) centre of INRAE. The expected duration is from 5 to 6 months. The internship student will get a "gratification" of about 550 EUR per month. APPLICATION Send a cover letter, a CV and the list of classes taken in Master 1 and Master 2 with all available marks to gildas.mazo@inrae.fr and/or florence.jaffrezic@inrae.fr.
En savoir plus :https://maiage.inrae.fr et http://genome.jouy.inra.fr/~gmazo/
Contact :gildas.mazo@inrae.fr
CONSULTANT - FORMATEUR STATISTIQUES
Publiée le 08/09/2021 16:49.
Référence : ARKESYS 2021.
CDI, LYON.
Entreprise/Organisme :ARKESYS
Niveau d'études :Master
Durée du contrat :CDI ou VACATIONS selon souhait
Secteur d'activité :FORMATION POUR ADULTES, PUBLIC ENTREPRISE, RECHERCHE
Description :• Animer des formations sur les méthodes et les logiciels de statistique • Intégrer une équipe de formateurs avec comme champ de compétences principal la statistique. • Contribuer à la réalisation de supports pédagogiques (supports de formation, livrets d’exercices, quiz) sur les méthodes et logiciels statistiques • Enrichir le savoir-faire de la société Arkesys sur des thématiques telles que le datamining, Big Data, IA, … • Développer le champ de compétences sur des langages tels que R, Python,…
En savoir plus :NA
OFFRE EMPLOI - Formateur STAT- Société ARKESYS.pdf
Contact :thierry.anthouard@arkesys.fr
Post-doctoral Position
Publiée le 08/09/2021 16:49.
Postdoc, Hôpital Hôtel-Dieu, 1 place du Parvis Notre-Dame 75004 Paris.
Entreprise/Organisme :Université de Paris
Niveau d'études :Doctorat
Durée du contrat :12 months (depending on the starting date)
Description :The team METHODS of the Centre de Recherche Epidémiologie et Statistiques/Université de Paris (CRESS-UMR1153) is looking for a post-doctoral fellow. The project has for objectives to develop innovative approaches to identify individualized treatment strategies using both randomized trial and observational data. Different aspects of this question can be studied according to the candidate’s expertise. Possible topics are: (1) When more than two treatment options exists; (2) When the treatment initiation is decided during follow-up (time-varying treatment); (3) Development of individualized treatment rules taking into account multidimensional aspects, such as individual benefits and risks; (4) Evaluation of the robustness of individualized treatment strategies. The methods developed will be applied to real data, but the project also includes questions regarding the generation of high-quality synthetic clinical data. More details available in the associated pdf file
En savoir plus :https://drive.google.com/file/d/1bge3l768rKT8CjUuHr8hPpXlWhxKKD9p/view?usp=sharing
Postdoc in statistical method for precision medicine.pdf
Contact :raphael.porcher@aphp.fr
biostatisticien
Publiée le 02/09/2021 22:12.
Référence : 210901 Effi-Stat offre d'emploi.
CDI, Paris.
Entreprise/Organisme :Effi-Stat (filiale d'AMITIS)
Niveau d'études :Master
Date de début :dès que possible
Secteur d'activité :Conseil en Statistique et Analyse des Essais Cliniques (société de services)
Description :VOUS AUREZ POUR MISSION : • la conception et la rédaction des aspects méthodologiques de protocoles d’études ; • la préparation des plans d’analyse statistique ; • la réception et la qualification de la base de données ; • la réalisation de l’analyse statistique à partir d’une programmation SAS™ ; • la rédaction du rapport d’analyse ou de la section statistique du rapport d'étude; • la présentation des résultats et la discussion de ceux-ci avec les cliniciens.
En savoir plus :www.amitis.com
210901 Effi-Stat offre d'emploi.pdf
Contact :job1@effi-stat.com
Biostatisticien méthodologie et simulations
Publiée le 02/09/2021 10:00.
CDI, Chilly-Mazarin.
Entreprise/Organisme :SANOFI
Niveau d'études :Master
Description :https://sanofi.wd3.myworkdayjobs.com/SanofiCareers/job/Chilly-Mazarin/Associate-Statistical-Project-Leader-M-F_R2608226-1
En savoir plus :NA
Contact :marie-karelle.riviere@sanofi.com
Poste biostatisticien Centre Antoine Lacassagne, Nice
Publiée le 02/09/2021 10:00.
CDI, Nice.
Entreprise/Organisme :Centre Antoine Lacassagne
Niveau d'études :Master
Date de début :Octobre 2021
Secteur d'activité :Hospitalier/cancérologie
Description :Prendre en charge l’aspect méthodologique et biostatistique des études de recherche biomédicale en cancérologie (phase I, II, III, observationnelle, pronostique, diagnostique) sous la supervision d’un biostatisticien senior. • Aide à la rédaction de protocoles, en collaboration avec le clinicien: o Définir la méthodologie de l'étude (design, objectifs, critère de jugement, population d'étude, plan d'analyse statistique). o Calcul du nombre de patients à inclure. • Suivi des essais gérés dans le département en collaboration avec les cliniciens, les data managers et les chefs de projets. • Réalisation des analyses statistiques • Rédaction des rapports d’analyses (revue de cas, analyses intermédiaires et de fin d’étude) • Participation à la rédaction d’articles scientifiques.
En savoir plus :https://www.centreantoinelacassagne.org/
Poste Biostatisticien Nice.pdf
Contact :jocelyn.gal@nice.unicancer.fr
Analyses d'incertitudes associées à des prévisions d'ensemble dans les OAD agricoles
Publiée le 02/09/2021 09:50.
Postdoc, Toulouse.
Entreprise/Organisme :ACTA - INRAE - Meteo France
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :dec 2021
Durée du contrat :18 mois
Secteur d'activité :conseil en agriculture
Description :L’agriculture compte parmi les activités les plus impactées par les aléas météorologiques, modulant notamment le cycle cultural, la gestion de l’irrigation, la protection des cultures, ... Ce secteur est fortement demandeur d’outils d’aide à la décision (OAD) visant à ajuster les opérations culturales selon les contraintes de la météo. À cet effet, de plus en plus d’agriculteurs s’équipent de stations IoT pour alimenter les OAD en observation météorologique in situ au plus près de leur exploitation. Néanmoins, le déploiement de ces nouvelles stations à bas coût pose la question de leur qualité, de leur implantation, de leur maintenance et des procédures pour compléter les données manquantes. En parallèle, depuis quelques années, les prévisions météo évoluent, offrant maintenant une information sur l’incertitude. Ces prévisions probabilistes, aussi dites d’ensemble, permettent de proposer des scénarios réalistes pour représenter les incertitudes des prévisions jusqu’à 15 jours. Tous ces éléments participent à la construction d’une agriculture de précision. L’objectif de ce post doc est de mener des travaux sur ce sujet, selon deux axes. Le premier axe visera à mettre en évidence l’apport d’algorithmes de traitement des mesures des stations IoT mises en place dans le projet METEOPREC. Outre leur utilité pour la maintenance, ces algorithmes permettent de sécuriser l’utilisation de ces mesures, notamment dans des OAD agricoles. En effet, ces derniers sont sensibles aux erreurs sur les variables clefs que sont la température, l’humidité relative ou la pluie. Le second axe portera sur l’utilisation conjointe de données météo de station avec des prévisions d’ensemble dans le cadre de 2 OAD de gestion de l’irrigation en vigne et maïs. Il permettra de montrer l’intérêt des approches de prévision d’ensemble par rapport aux prévisions classiques ou encore à des approches fréquentielles. Ces travaux seront valorisés sous la forme de deux articles scientifiques.
En savoir plus :http://www.modelia.org/moodle/mod/resource/view.php?id=2109
offreEmploi.DigitAg_postdoc18mois_Acta.pdf
Contact :francois.brun@acta.asso.fr

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