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Stage M2 recherche : Relative survival analysis in Julia

Publiée le 08/01/2024 11:42.

Stage, Marseille.

Entreprise/Organisme :	SESSTIM, Université Aix-Marseille
Niveau d'études :	Master
Sujet :	Relative survival analysis in Julia
Durée du contrat :	6 mois
Description :	Survival analysis is a statistical theory targeted at the study of human lifetime. In particular, relative survival analysis deals with the case of datasets that do not contain the reason of death of the patients, this information (supposed binary: studied cause or other causes) has to be estimated [1,2]. This arises quite frequently in large cancer studies due to, e.g., unreliable data. Most of the implementations of relative survival statistical routines target an interface in R, with some underlying C++, which is suboptimal and, most importantly, hard to maintain and expand in the long run. The main objective of the internship is to develop a new library in the -- rising -- programming language Julia to deal with relative survival analysis problem efficiently. This starts by the re-implementation of standard algorithms, while reviewing the literature, along which a real dataset will be used as a test case. Compatibility with the Julian ecosystem will be key (we will more specifically target the `StatsModels.jl` API), unlocking the application of bleeding-edge statistical tools (including, e.g., neural networks) to relative survival problems in the future. The communication and publication of our results will be an integral part of the work. This is also a very good opportunity to learn a new programming language, that is gaining traction is academic and in the industry.
En savoir plus :	https://sesstim.univ-amu.fr/sites/default/files/intership_offer.pdf intership_offer.pdf
Contact :	oskar.laverny@univ-amu.fr

Contribuer au développement d'un package R et d'une application Shiny sur les mobilités

Publiée le 04/12/2023 12:29.

Stage, Rennes.

Entreprise/Organisme :	IRMAR - CREM
Niveau d'études :	Master
Date de début :	idéalement mai 2024
Durée du contrat :	3 mois
Description :	Châteaubourg est la ville ayant la plus grosse densité au monde de données associées aux mobilités (voitures, vélos, piétons, poids-lourds). En effet, depuis trois ans, une quinzaine de capteurs Telraam mesure le flux de chaque mobilité toutes les heures, en distinguant les sens de parcours. Plus de 750 000 données ont été collectées et cela continue ! Le stage s’inscrit dans une collaboration entre l’association Agis-Ta-Terre qui installe et maintient ces capteurs et des enseignants-chercheurs de l’Université de Rennes. Cette collaboration vise à développer des outils permettant de sensibiliser les citoyens sur l’usage des transports, mais aussi à aider les décideurs et les cabinets d’urbanisme quant à l’aménagement des territoires. L’objectif est de contribuer à un développement durable en mettant à disposition des outils libres et gratuits. Ce travail est actuellement valorisé via une interface Rshiny qui a été réalisée à cet effet et qui est déployée sur GitHub. Le package d’interface est propre aux données issues de Châteaubourg, il exploite les sources et modules déposés sur un package de traitement statistique qui vise à proposer des outils génériques de traitement des données Telraam. Dans le cadre de cette politique de programmation libre et collaborative, il est important de respecter les standards de programmation. Mais il est également important de proposer une interface ergonomique et exploitable par tout.e citoyen.ne. L’objectif du stage concerne essentiellement le développement des codes en R présents sur les deux packages et de contribuer au dépôt d’un package R sur le CRAN. Les détails du sujet et les contacts sont spécifiés dans le fichier joint.
En savoir plus :	NA Stage_CapteurProg_2024.pdf
Contact :	ketsia.guichard@gmail.com

Inserm chair: Computational modeling for multi-omics data

Publiée le 04/12/2023 12:29.

Référence : CPJ COMPO.

CDD, Marseille.

Entreprise/Organisme :	Inserm
Niveau d'études :	Doctorat
Date de début :	09/2024
Durée du contrat :	4 years
Rémunération :	3 500€ - 5 000€ according to research experience
Secteur d'activité :	Research and clinical oncology
Description :	The generalization of new generation sequencing data (i.e., multi-omics: genomics, transcriptomics, proteomics,) as well as the emergence of new methods (single cell sequencing, spatial transcriptomics) opens new research horizons on cancer pathologies. These data, of very large dimensions and volume, bring new methodological challenges in terms of statistical and mathematical analysis, as well as computational modeling. The development and numerical implementation of novel methods has become a key issue in modern oncology, both in terms of understanding the biology of cancers and for medical oncology. On the first aspect, the analysis and modeling of these data is, for example, fundamental for the study of key phenomena such as intra- and inter-tumor heterogeneity of cancer cells and their microenvironment. On the other hand, the integration of multi-omics data into predictive artificial intelligence models will allow the development of precision medicine based on personalized treatments. This recruited researcher will aim at developing cutting-edge computational methods to leverage multi- omics and single-cell resolution data into novel and translational discoveries in cancer research. This will be performed in synergistic interaction with the other CRCM teams.
En savoir plus :	https://eva3-accueil.inserm.fr/sites/eva/chaires/2024/Pages/Projets.aspx Inserm_Projet_de_Chaire_2024_U1068_pr_aff.pdf
Contact :	sebastien.benzekry@inria.fr

Offre de stage: Physics Informed Neural Networks for lake pollution forecast

Publiée le 22/11/2023 14:37.

Stage, Montpellier.

Entreprise/Organisme :	MISTEA - INRAE
Niveau d'études :	Master
Sujet :	Teasing: The goal will be to build a fancy Machine Learning model that is aware of the laws of physics, a.k.a. Physics Informed Neural Networks (PINN), for a real life environmental application. In particular, we will try to combine generative models (like GANs & co) to time serie forecast with some imposed physics knowledge to get accurate forecast.
Durée du contrat :	4-6 months
Rémunération :	Gratification de stage environ 600€/mois
Description :	The internship will take place in MISTEA unit. Contact me with your questions.
En savoir plus :	https://mistea.montpellier.hub.inrae.fr/actualites/offre-de-stage-de-master-2024 offre_stage_PINN_MISTEA.pdf
Contact :	david.metivier@inrae.fr

Poste PR section 26 statistique

Publiée le 14/11/2023 11:56.

CDI, Pau.

Entreprise/Organisme :	Université de Pau et des Pays de l'Adour
Niveau d'études :	Autre
Date de début :	Septembre 2024
Durée du contrat :	Fonctionnaire
Rémunération :	Selon grille fonctionnaire
Secteur d'activité :	Enseignement supérieur & recherche
Description :	Un poste de professeur(e), section 26, en statistique, devrait mis au concours en 2024 à l’Université de Pau et des Pays de l’Adour pour une prise de fonction en septembre 2024. Le poste sera rattaché au Laboratoire de Mathématiques et de leurs Applications de Pau (LMAP UMR CNRS 5142) pour la recherche et au département Science des Données (SD) de l'IUT des Pays de l'Adour pour l’enseignement. Le LMAP et le département SD se trouvent sur le campus palois de l’Université de Pau et des Pays de l’Adour.
En savoir plus :	https://lma-umr5142.univ-pau.fr/fr/vie-du-laboratoire/recrutement.html PostePR26StatUPPA-1.pdf
Contact :	ivan.kojadinovic@univ-pau.fr

Statisticien / Gestionnaire de bases de données

Publiée le 20/10/2023 09:12.

Référence : Statisticien / Gestionnaire de bases de données (INSERM).

CDD, Maternité Port-Royal, 123 bd Port-Royal, 75 014 Paris.

Entreprise/Organisme :	INSERM
Niveau d'études :	Master
Date de début :	01/02/2024
Durée du contrat :	12 mois, renouvelable
Rémunération :	A partir de 2494,30 euros brut mensuels, selon l’expérience et le niveau de formation
Secteur d'activité :	Santé
Description :	EPOPé est une équipe de recherche mixte de l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (INSERM) et de l’université Paris Cité, appartenant au Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique (CRESS). Nos recherches portent sur la santé des femmes pendant la grossesse et ses suites, la santé des enfants liée au contexte de la naissance et la santé des enfants en pédiatrie courante, en France et au niveau international. Au sein de l’équipe EPOPé, le/la statisticien(ne) travaille sur les données de 2 projets de recherche : - il/elle exploite les données, définit et met en oeuvre des analyses statistiques qui visent à développer, valider et analyser des indicateurs de santé relatifs aux femmes enceintes et aux nouveau-nés à partir des bases de données médico-administratives du Système National des Données de Santé (SNDS) (temps dédié : mi-temps) ; - il/elle participe à l’harmonisation de ces indicateurs au sein d’un réseau européen.il/elle exploite la base de données du registre des malformations congénitales de Paris (remaPAR) qui enregistre de manière continue, depuis 1981, tous les cas d’anomalies congénitales détectées en prénatal ou durant la première semaine de vie parmi les naissances vivantes, les mort-nés et les interruptions médicales de grossesse. Les objectifs principaux sont d’assurer la surveillance épidémiologique des anomalies congénitales, d’évaluer les pratiques et les politiques de santé, et de contribuer à la recherche étiologique (temps dédié : mi-temps).
En savoir plus :	https://rh.inserm.fr/nous-rejoindre/Lists/Emploi%20ITA/Attachments/4415/U1153%20-%20CRESS%20-%20Stat U1153- StatisticienSNDSREMAPAR_2024.pdf
Contact :	isabelle.monier@inserm.fr

Poste de Maître de conférences en apprentissage statistique et machine learning

Publiée le 06/10/2023 11:52.

CDI, Lyon, campus de Bron.

Entreprise/Organisme :	Université Lyon 2
Niveau d'études :	Doctorat
Date de début :	01/09/2024
Description :	Un poste de maître de conférences en apprentissage statistique et machine learning sera ouvert au prochain concours (session synchronisée), pour un rattachement au laboratoire ERIC pour la partie recherche et à l'Institut de la Communication pour la partie enseignement.
En savoir plus :	https://eric.msh-lse.fr 2024-univlyon2-posteMCF2627.pdf
Contact :	julien.jacques@univ-lyon2.fr

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