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Ingénieur(e) Data Analyste en pharmacoépidémiologie
Publiée le 19/05/2025 09:45.
CDD, 270 boulevard de Sainte Marguerite, 13009 Marseille.
Entreprise/Organisme :Assistance Publique – Hôpitaux de Marseille
Niveau d'études :Master
Date de début :Dès que possible
Durée du contrat :1 an renouvelable
Rémunération :https://www.emploi-collectivites.fr/grille-indiciaire-hospitaliere-ingenieur-hospitalier-ih/4/101.ht
Description :Grade et contrat Ingénieur hospitalier (rémunération selon expérience conformément à la grille correspondante) CDD 1 an renouvelable CA et RTT Poste à pourvoir dès que possible Site et service Assistance Publique – Hôpitaux de Marseille Hôpital Sainte Marguerite 270 boulevard de Sainte Marguerite, 13009 Marseille Service de pharmacologie clinique et pharmacovigilance (cheffe de service : Pr Joëlle Micallef) Unité de pharmacoépidémiologie Organisation du temps de travail et horaires • Poste de jour : Oui • Poste à repos fixe : Oui • Poste à temps plein : Oui • Possibilité d’évolution du poste : Oui • Amplitude horaire du service : 8 h 30 – 19 h 00 • Horaires du poste : 9 h 00 – 17 h 00 avec pause déjeuner, du lundi au vendredi, hors samedi, dimanche et jours fériés Missions générales de l’emploi Le poste à pourvoir est un poste d’ingénieur avec une compétence de Data Analyste pour des projets de pharmacoépidémiologie. Ces projets portent sur l’évaluation de l’utilisation, du mésusage et des risques des médicaments psychoactifs, à partir du Système national des données de santé (SNDS). Ces projets sont coordonnés par le Service Hospitalo-Universitaire de Pharmacologie Clinique et Pharmacosurveillance de l’Assistance Publique – Hôpitaux de Marseille qui a une expérience de plus de 20 ans pour la recherche et la conduite d’études en pharmacoépidémiologie. La personne recrutée sera en charge du traitement des données du SNDS, en lien direct avec les porteurs du projet. La personne suivra les formations règlementaires pour accéder au portail sécurisé du SNDS (REQ-054-AM, REQ-256-AM et REQ-254-AM ; cf ci-dessous), afin de réaliser le data management et les analyses statistiques. Activités principales • Constituer les jeux de données exploitables à partir de données brutes extraites du SNDS, en fonction des analyses prévues dans le protocole • Construire les variables nécessaires à l’analyse à partir des informations contenues dans les différentes tables d’intérêt et en vérifier la cohérence • Effectuer les analyses statistiques prévues dans le protocole, vérifier les conditions d’applications et proposer des alternatives • Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques ou d’articles • Veiller à la reproductibilité et à la documentation des traitements réalisés Formation et expérience requises • Master ou doctorat en pharmacoépidémiologie, épidémiologie, statistiques, bio-informatique ou santé publique • Expérience appréciée dans l’utilisation des données du SNDS à des fins de recherche, en particulier dans le domaine de la pharmacoépidémiologie Qualités requises • Travailler en équipe et interagir avec différents interlocuteurs (pharmacologues, pharmacoépidémiologistes, médecins, pharmaciens, partenaires scientifiques) • Capacité à apprendre et s’adapter (langages informatiques, méthodes statistiques et de pharmacoépidémiologie) • Sens de l’organisation et de la planification • Autonomie • Raisonnement analytique • Curiosité intellectuelle Connaissances souhaitées ou engagement à les acquérir • Formations « Architecture et données du SNIIRAM/SNDS » (REQ-054-AM, 1 jour, e-learning), « Données d’extraction DCIR pour les accès sur projet » (REQ-256-AM, 2,5 jours, Paris) et « Initiation au PMSI à travers le SNDS » (REQ-254-AM, 3 jours, Paris) pour accéder au SNDS • Traiter des données, manipuler et requêter une base de données volumineuse • Programmer dans un environnement informatique contraint (portail sécurisé du SNDS) • Langages informatiques SQL (Oracle) et R (RStudio), éventuellement SAS (Entreprise Guide) • Statistiques multivariées, analyse de données censurées (modèle de Cox, variables dépendantes du temps), analyse de séries chronologiques (ARIMA) • Connaissance du SNDS • Connaissance en pharmacoépidémiologie ou en épidémiologie • Lecture de l'anglais scientifique et technique Modalités de candidature CV et lettre de motivation à thomas.soeiro@ap-hm.fr et joelle.micallef@ap-hm.fr
En savoir plus :https://fr.ap-hm.fr/service/pharmacologie-clinique-et-pharmacosurveillance-hopital-sainte-marguerite
Ingénieur(e) Data Analyste pour un projet de pharmacoépidémiologie 20250516.pdf
Contact :thomas.soeiro@ap-hm.fr
Biostatisticien.ne
Publiée le 12/05/2025 18:07.
CDD, Dijon.
Entreprise/Organisme :CHU Dijon
Niveau d'études :Master
Date de début :Dès que possible
Durée du contrat :CDD de 12 mois avec possibilité d’évolution
Rémunération :selon grille et expérience (entre 28K€ et 36K€ brut/an)
Description :Recrutement d’un ingénieur biostatisticien Centre d’Investigation Clinique – Module épidémiologie clinique. INSERM CIC1432 CHU DIJON Présentation de la structure Le Centre d’Investigation Clinique – Module épidémiologie clinique (CIC-EC) de Dijon est une structure labellisée par l’INSERM et la DGOS qui a pour mission d’apporter une aide méthodologique et logistique aux médecins cliniciens du CHU et aux chercheurs du site souhaitant développer des projets dans le domaine de l’épidémiologie clinique, des essais thérapeutiques de phase II/III multicentriques et des études en santé publique. Composé d’une équipe multidisciplinaire (épidémiologistes, biostatisticiens, data-managers, coordonnatrices d’études cliniques, techniciennes d’étude clinique, ingénieur informaticien, sociologue, économiste de la santé), son activité s’exerce principalement dans les thèmes suivants : génétique clinique/pédiatrie, réadaptation fonctionnelle, inflammation/infection, cancérologie. De plus le CIC-EC développe des recherches sur les inégalités sociales et géographiques de santé, sur leur impact sur la prise en charge et le devenir des patients ainsi que sur le vécu des patients et de leur entourage. Missions / activités Dans le champ des activités de recherche clinique, en santé publique et dans le domaine des sciences humaines et sociales portées par la FHU Translad en lien avec le CIC1432 : - Participation à la conception des protocoles de recherche en concertation avec l’épidémiologiste de l’étude et l’investigateur coordonnateur : • Participation à la planification des études : formalisation des objectifs et des critères de jugement, choix du design, définition des populations d’analyse, détermination de la taille des échantillons et planification des analyses intermédiaires • Elaboration de la stratégie d’analyse statistique et choix des méthodes d’analyse les plus adaptées • Participation à la rédaction du protocole • Rédaction des plans d’analyses statistiques - Préparation des données : • Participation à l’élaboration des supports de recueil de données et validation de ces derniers avant leurs mises en production • Veille à la sécurité et à la qualité des données • Participation à la revue des données - Analyse des données • Réalisation des analyses statistiques et interprétation des résultats en relation avec l’épidémiologiste et l’investigateur coordonnateur • Rédaction du rapport d’analyse statistiques - Aide à la valorisation scientifique : participation à la rédaction des articles scientifiques (notamment parties méthodes statistiques et résultats) et à la réponse aux reviewers - Participation à la rédaction et l’actualisation des processus et procédures liées à ses activités Relations de travail les plus fréquentes • Relations avec les équipes de la FHU TRANSLAD : médecins coordonnateurs, investigateurs, chercheurs en bioinformatique, et en SHS • Relations au sein du CIC : Epidémiologiste, Data manager, Coordonnateur d’Etudes Cliniques (CEC), économiste de la santé, sociologue… • Relations externes : Investigateurs coordonnateurs, pharmacovigilants, et autres collaborateurs scientifiques (chercheurs, économistes de la santé, psychologie sociale…) Compétences requises : - Maîtrise des différents tests statistiques usuels (Chi2, Fisher, McNemar, Student, Wilcoxon…) - Maîtrise des méthodes statistiques appliquées aux sciences de la vie (régression linéaire, régression logistique, modèles de survie, modèles de régression multiple à effets fixes et aléatoires, modèles GEE, modèles multi-états…) - Maîtrise des logiciels statistiques (R, SAS, Stata…) - Savoir réaliser un calcul de puissance ou de nombre de sujets nécessaires (PASS, R, SAS…) - Savoir traiter les données manquantes - Maîtriser l’anglais scientifique Qualités professionnelles - Savoir travailler en équipe - Être autonome, savoir organiser son travail et ses priorités - Être rigoureux Expérience Une première expérience professionnelle (1 à 2 ans) des statistiques appliquées aux essais cliniques et/ou à l’épidémiologie acquise dans une CRO, un CIC ou un laboratoire de recherche serait appréciée mais non indispensable Niveau requis  Bac+5 minimum en Biostatistiques : école d’ingénieur en biostatistiques (type ENSAI, ISUP,...), master ou doctorat en biostatistiques Informations pratiques :  Poste à 100% au CIC-EC, à pourvoir dès que possible  CDD avec possibilité d’évolution  Rémunération selon grille et expérience (entre 28K€ et 36K€ brut/an)  Les petits + : o Accès à l’ensemble du Plan de formation, très fourni (5 millions € par an dédiés à la formation) o Accès aux selfs du CHU, possibilité de demander des places de crèche du CHU o Accès au CGOS : vacances à prix réduit, tarifs préférentiels sur des spectacles, places de cinéma, parc d’attractions, chèque culture, chèques vacances, etc. o Prise en charge de 75% de l’abonnement de transport en commun o Ateliers bien-être et salle de sport accessibles gratuitement  Candidature (lettre de motivation + CV) à adresser par mail à : E-Mail : isabelle.fournel@u-bourgogne.fr; abderrahmane.bourredjem@u-bourgogne.fr
En savoir plus :https://carrieres.chu-dijon.fr/fr/annonce/3651949-biostatisticienne-biostatisticien-21000-dijon
Annonce Recrutement-biostatisticien 2025.pdf
Contact :abderrahmane.bourredjem@u-bourgogne.fr
Evaluation de l’influence du paysage sur le risque acarologique : approche par modélisation
Publiée le 12/05/2025 18:07.
Référence : Thèse tiques et paysage INRAE Nantes.
Thèse, INRAE (unité BIOEPAR), Nantes.
Entreprise/Organisme :INRAE
Niveau d'études :Master
Sujet :Evaluation de l’influence de la connectivité entre les éléments boisés du paysage sur le risque acarologique : approche par modélisation L’émergence des maladies animales et zoonotiques transmises par les tiques est influencée par des interactions complexes entre les tiques, les agents transmis, les hôtes réservoirs vertébrés et leurs habitats. Les changements de composition du paysage peuvent modifier fortement les rapports entre les espèces et l’abondance des populations, jouant ainsi sur le « risque acarologique », défini par la densité de tiques infectées par un agent pathogène. Ce travail vise à une réflexion méthodologique approfondie sur la façon de modéliser l’influence du degré de fragmentation des paysages agricoles bocagers sur le risque acarologique dans des espaces boisés, sur l’exemple des bactéries du genre Borrelia, agents de la maladie de Lyme. Des analyses statistiques bayésiennes sur des jeux existants de données observées et paysages réels permettront d’identifier les variables influençant le risque dans des habitats boisés d’un paysage bocager. Ces variables seront intégrées dans un modèle dynamique reposant sur le couplage entre un modèle de paysage et un modèle de transmission de bactéries au sein de populations de tiques. Développé dans un cadre conceptuel de métapopulations, ce modèle permettra d’explorer des scénarios d’une manière théorique et par confrontation avec les données, notamment sur l’influence respective des caractéristiques des éléments boisés (taille, composition) et de leur agencement dans l’espace.
Date de début :01/11/2025
Durée du contrat :3 ans
Rémunération :2200€ brut /mois
Description :"Evaluation de l’influence de la connectivité entre les éléments boisés du paysage sur le risque acarologique : approche par modélisation" Cette thèse sera co-encadrée par Thierry Hoch, Suzanne Bastian (tous de l'UMR Oniris-INRAE BIOEPAR, Santé Animale) et Emily Walker (UR INRAE BIOSP, Mathématiques et Numérique). Le descriptif du projet est disponible sur le site de candidature de l'Ecole Doctorale : https://amethis.doctorat.org/amethis-client/prd/consulter/offre/1626 La date limite de candidature est fixée au 10 juin 2025.
En savoir plus :https://amethis.doctorat.org/amethis-client/prd/consulter/offre/1626
Contact :thierry.hoch@inrae.fr
Alternant en statistique / analyse de données(Niveau Master)
Publiée le 06/05/2025 09:31.
Référence : AP-2025-055.
Stage, Saint Brieuc (Ploufragan).
Entreprise/Organisme :Anses (Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail)
Niveau d'études :Master
Sujet :Le laboratoire de l’Anses de Ploufragan-Plouzané-Niort regroupe plus de 200 personnes, organisées en 8 unités de recherche et 2 services expérimentaux. Il concourt au travers de ses activités de recherche à l’amélioration de la santé et du bien-être des animaux, ainsi qu’à la qualité sanitaire des denrées d’origine animale et à l’étude de la sécurité des conditions de travail en élevage, en lien étroit avec ses tutelles, dont les ministères de la santé, de l’agriculture, de l’environnement et du travail, ainsi qu’avec les filières de production. Au sein de ce laboratoire, vous travaillerez dans l’unité d’Epidémiologie, Santé et Bien-Etre (EpiSaBe) qui conduit des recherches interdisciplinaires mêlant résultats de laboratoire (virologie, bactériologie, génomique), résultats d’études expérimentales et enquêtes d’épidémiologie observationnelle conduites en élevage (questionnaires, capteurs d’ambiance, mesures de bien-être des animaux).
Date de début :Septembre 2025
Durée du contrat :1-3 ans
Rémunération :Selon les grilles de salaires en cours
Secteur d'activité :Epidémiologie humaine/vétérinaire (One Health), sécurité alimentaire
Description :Sous l’encadrement de votre maitre d’apprentissage, vous serez amené à :  Construire un protocole d’analyse statistique associé aux questions posées par les scientifiques du laboratoire.  Réaliser l’analyse statistique des données (logiciel R)  Rédiger le rapport d’analyse statistique (format Rmarkdown)  Interpréter et présenter les résultats aux scientifiques  Si besoin, réaliser une application disponible en ligne (R-Shiny)
En savoir plus :No link
AP-2025-055 Statisticien - analyste de données.pdf
Contact :stephanie.bougeard@anses.fr
Researcher in clinical evaluation and regulation of Digital Medical Devices
Publiée le 14/04/2025 09:41.
CDD, Paris (75), France.
Entreprise/Organisme :Inria
Niveau d'études :Master
Date de début :Between June and August 2025
Durée du contrat :2 years
Rémunération :According to experience.
Secteur d'activité :Clinical evaluation ; regulation.
Description :The HeKA team at Inria, Inserm, and University Paris Cité is seeking a motivated researcher to join the SMATCH (Statistical and AI based Methods for Advanced Clinical Trials CHallenges in Digital Health) project, which is part of the PEPR (“Programme et Equipements Prioritaires de Recherche” - Priority Research Programs and Equipment) Santé Numérique (Digital Health), co-leaded by Inserm and Inria. The objective of the SMATCH project is to develop and apply statistical and AI- based methods with the ultimate goal of accelerating the development of medical interventions (drugs and DMDs) during their evaluation in clinical trials. The consortium is made up of 16 teams, mainly from Inria and Inserm Centers recognized in this field, bringing a unique and complementary expertise in data sciences and AI applied to health problems and specifically to clinical trials. AI-based computational models can be used by health care professionals or patients within DMD (using the definition of EU regulation 2017/745) aiming at preventing, diagnosis, monitoring, treating or alleviating disease. These devices impact the health outcome of individuals as any other treatment, but they present many methodological challenges in their clinical evaluation. Further, regulators, are struggling in approving and labelling these DMDs as the clinical evidence provided by stakeholder is heterogeneous. This position will contribute to the development of a framework and guidelines for trials or study designs that could be used to evaluate DMDs. This work will be done with the collaboration of the Digital Health department of the HAS.
En savoir plus :https://recrutement.inria.fr/public/classic/fr/offres/2025-08764
2025-08764.pdf
Contact :sandrine.boulet@inria.fr
Permanent research engineer position as Head of Hub Algorithmics & AI pole
Publiée le 07/04/2025 16:24.
Référence : Permanent research engineer position as Head of Hub Algorithmics & AI pole.
CDI, Paris 15eme.
Entreprise/Organisme :Hub de bioinformatique et biostatistique de l'Institut Pasteur
Niveau d'études :Master
Durée du contrat :CDI
Secteur d'activité :bioinformatics, artificial intelligence, management
Description :The Hub of Bioinformatics and Biostatistics provides analytical support to research units and platforms at the Institut Pasteur. The Hub is committed to this mission through: Collaborating on scientific projects, submitted by research teams of our institute, to the Hub. Training scientific staff from the Institut Pasteur Paris or from other institutes of the international network of Instituts Pasteur. Developing tools and applications to be shared with the broader scientific community Interacting directly with scientist upon specific inquiries As head of the Algorithmics, AI, and Mathematical Modeling group, the recruited engineer will focus on applying and developing innovative AI solutions for genomics projects of the Institut Pasteur. He will oversee the group management and be accountable for its project portfolio. The recruited engineer will work with a team of computational biologists in a collaborative environment, interacting with other teams of the Hub, the Technology Department, the Computational Biology department, and the campus. As part of the Bioinformatics and Biostatistics Hub, the group lead will: Manage the group’s collaborative project portfolio Ensure the quality of work and scientific contributions of the engineers in the group Oversee administrative management and foster an open, collaborative work environment Support the professional development of team members Lead the methodological development in collaboration with the Computational Biology Department and the campus Represent the pole within the Technology Department and the campus As a member of the hub’s leadership team, the pole head will participate in the hub’s operational management and contribute to its strategy and implementation. Reporting: Reports to the Hub Leadership. Key Activities: Project planning and organization Project coordination, tracking, and resource management Thematic coordination of the group (methodological developments, best practices, etc.) Administrative management of the division Development of collaborators Workplace quality of life improvement Participation in hub leadership The group head role will represent approximately 50% of the workload. Additionally, the recruited candidate will act as a research engineer within the Hub, contributing to collaborative projects, teaching, and consulting in alignment with their leadership responsibilities. Profile: PhD/Master’s/Engineering degree in Computational Biology, Bioinformatics, Computer Science, Applied Mathematics, Biostatistics, or related fields At least 10 years of experience in a biomedical research institute and/or industry in computational biology, biostatistics, applied mathematics, or bioinformatics Proven expertise in deep learning, algorithmic approaches, and mathematical modeling applied to genomics Knowledge and experience in software development and best practices Strong leadership experience in group and/or project management in a complex organization; experience mentoring students Fluency in French and English, with experience working in multilingual environments Creativity and innovation Collaborative mindset, ability to manage complex and ambiguous situations Focus on professional development of team members To apply: Click on the following link and select the corresponding profile: https://hub-jobs2025.pasteur.cloud Please, submit your updated CV and a cover letter (motivation letter). You may indicate contact information for reference letters (3 max.). They will be automatically contacted when you validate your application.  We are a team committed to foster a fair, inclusive and diverse work environment. Diversity has been scientifically established as a key factor to improve scientific objectivity. Hence, all applicants will be evaluated solely based on qualification regardless of gender, gender identity, sexual orientation, race or disability.
En savoir plus :https://research.pasteur.fr/en/job/permanent-research-engineer-position-as-head-of-hub-algorithmics-
Contact :herve.menager@pasteur.fr
PhD in modeling of soils
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : DeepHorizon.
Thèse, AgroParisTech , Palaiseau.
Entreprise/Organisme :UMR MIA, AgroParisTech
Niveau d'études :Master
Sujet :Developing a statistical spatial soil inference system with quantified uncertainty
Date de début :march 2025 or later
Durée du contrat :3 years
Rémunération :monthly gross salary ~ 2,100 €
Secteur d'activité :Interdisciplinary research in statistical machine learning and environmental sciences
Description :In the framework of the EU-project DeepHorizon (https://cordis.europa.eu/project/id/101156701), we are looking for an excellent PhD candidate to develop statistical methods supporting the development of a spatial soil inference system for European soils. A soil inference system uses known measurements, each with a certain level of uncertainty, to predict related soil properties with minimal error, by applying a series of logically connected (pedo)transfer functions (PTFs). The PhD candidate will start with an inventory of existing soil pedotransfer functions relevant to European soils and to calibrate usual mechanistic biogeochemical models. A large part of the work involves the exploration, development and application of new statistical approaches relevant for the inference system. The approaches should handle missing data along with uncertainty quantification of the input soil properties and propagation of the uncertainty throughout the inference engine. The candidate is expected to collaborate closely with other PhD candidates of the project consortium and with a project partner in Belgium, for which temporary stay could be envisioned.
En savoir plus :https://cordis.europa.eu/project/id/101156701
PhD_topic_PTFs.pdf
Contact :tabea.rebafka1@agroparistech.fr
Clustering de données fonctionnelles avec application en océanographie
Publiée le 01/10/2024 09:26.
Référence : Clustering de données fonctionnelles avec application en océanographie.
Thèse, Conservatoire National des Arts et Métiers, 2 rue Conté 75003 Paris.
Entreprise/Organisme :Conservatoire National des Arts et Métiers, Laboratoire CEDRIC
Niveau d'études :Master
Sujet :Classification non-supervisée pour l'identification de paysages acoustiques homogènes
Date de début :Entre fin 2024 et début 2025 en fonction de la date de recrutement du candidat
Durée du contrat :3 ans
Secteur d'activité :recherche
Description :Voir pièce jointe
En savoir plus :https://vincentaudigier.weebly.com/uploads/1/7/3/1/17317324/these_cnam_shom_clustering.pdf
these_cnam_shom_clustering.pdf
Contact :vincent.audigier@cnam.fr

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